典型文献
基于聚合酶区和衣壳区测序的诺如病毒暴发疫情溯源
文献摘要：
目的 分析一起厨工相关诺如病毒暴发的病原学特征,为诺如病毒感染的溯源提供证据.方法 利用Fil-marray病原体检测系统初筛,根据感染性腹泻诊断标准WS 271-2007进行细菌分离,同时进行诺如病毒荧光PCR检测,对诺如病毒阳性核酸进行聚合酶区和衣壳区序列扩增,测序比对,利用Mega软件分析同源性.结果 49份患者标本中,诺如G Ⅱ型阳性率为48.98％(24/49),G Ⅰ型阳性率为2.04％(1/49),G Ⅰ、G Ⅱ混合阳性率为2.04％(1/49);115份厨工及餐饮工作人员标本中,GⅡ型阳性率为13.04％(15/115),GⅠ型阳性率为0.87％(1/115).38份环境涂抹样中,G Ⅱ型阳性率为2.63％(1/38).有17份标本诺如病毒聚合酶区和衣壳区测序成功,其中患者G Ⅱ型14份,G Ⅰ型1份,厨工G Ⅱ型2份.比对结果显示1份GⅠ亚型为G Ⅰ.P4-G Ⅰ.5,16份G Ⅱ亚型均为G Ⅱ.P7-G Ⅱ.6.两份厨工和14份患者标本的诺如病毒核酸序列同源性达99％.49份患者标本中,致泻性大肠埃希菌毒力基因阳性率为34.69％ (17/49),患者标本中合并诺如病毒核酸阳性和致泻性大肠埃希菌毒力基因阳性的有5份,阳性率为10.20％(5/49).16份诺如病毒核酸阳性的厨工标本中,均未检出致泻性大肠埃希菌毒力基因,其余样本未进行致泻性大肠埃希菌检测.结论 该起疫情是由诺如病毒G Ⅱ.P7-G Ⅱ.6亚型引起,患者和厨工极有可能来自同一传染源,同时合并致泻性大肠埃希菌感染,应加强厨工及餐饮服务人员的体检和培训.
文献关键词：
急性胃肠炎;诺如病毒;混合感染;基因型
中图分类号：
作者姓名：
何娇明;俞慕华;陈辉;马艳萍;张海龙;鞠长燕
作者机构：
深圳市南山区疾病预防控制中心,广东深圳518054;深圳市疾病预防控制中心,广东深圳518055
文献出处：
引用格式：
[1]何娇明;俞慕华;陈辉;马艳萍;张海龙;鞠长燕-.基于聚合酶区和衣壳区测序的诺如病毒暴发疫情溯源)[J].中国热带医学,2022(01):63-67
A类：
marray
B类：
衣壳,诺如病毒,暴发疫情,疫情溯源,厨工,病原学特征,提供证据,Fil,病原体检测,初筛,感染性腹泻,诊断标准,WS,细菌分离,病毒阳性,Mega,合阳,涂抹,P4,P7,两份,病毒核酸,序列同源性,致泻性大肠埃希菌,毒力基因,未检,能来,一传,传染源,大肠埃希菌感染,餐饮服务,服务人员,急性胃肠炎,混合感染,基因型
AB值：
0.282685
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