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2012-2018年长春市手足口病非肠道病毒A组71型肠道病毒VP1基因特征分析
文献摘要：
目的 分析2012-2018年长春市手足口病(hand,foot and mouth disease,HFMD)非肠道病毒A组71型(en-teroviruses A71,EV-A71)肠道病毒VP1基因特征,探讨其流行规律,为及时调整防控策略提供参考.方法 收集2012-2018年长春市医疗机构报告的HFMD临床诊断病例样本,选取非EV-A71型肠道病毒对其VP1区扩增并测序,比对构建系统进化树,进行核苷酸同源性及氨基酸变异位点分析.结果 2012—2018年长春市HFMD病例中共获得83条柯萨奇病毒A组16型(coxsackievirus A16,CV-A16)序列、30条柯萨奇病毒A组6型(CV-A6)序列和10条柯萨奇病毒A组10型(CV-A10)序列,其中CV-A16序列全部属于B1亚型,除2012年1条和2018年7条序列属于B1a亚型,其他均属于B1b亚型,各株间核苷酸序列同源性为88.2％～100.0％.2012—2018年长春市HFMD病例中CV-A6毒株相对集中,30条序列均属于D3亚型,与D3亚型参考株的同源性为92.8％～98.1％,各株间同源性为91.6％～99.8％;CV-A10毒株相对集中,10条序列均属于D2亚型,与D2亚型同源性较高为96.4％～98.4％,各株间同源性为96.4％～100.0％;CV-A16毒株中存在14个氨基酸位点变异,有12株发现在第14位点上发生N天冬酰胺→S丝氨酸(N14S)的变异,其中9株同时存在L215P变异.有9株存在M23L变异,其中8株为B1a亚型.结论 2012—2018年长春市HFMD病例中CV-A16流行株均属于B1亚型,且同时存在B1b和B1a亚型,B1b为主要优势型别,毒株存在14个氨基酸位点变异,其中N14S和L215P可能成为稳定流行位点.CV-A6和CV-A10毒株相对集中,分别为D3和D2亚型,同源性较好.加强对非EV-A71型HFMD病原的检测,对HFMD疫情的防控具有重大意义.
文献关键词：
手足口病;肠道病毒;VP1蛋白;基因型别
中图分类号：
作者姓名：
张智丽;李晨光;张兴国;孙宇;崔薇;乔凤娟;孙炳欣
作者机构：
长春市疾病预防控制中心,吉林长春130033
文献出处：
引用格式：
[1]张智丽;李晨光;张兴国;孙宇;崔薇;乔凤娟;孙炳欣-.2012-2018年长春市手足口病非肠道病毒A组71型肠道病毒VP1基因特征分析)[J].中国生物制品学杂志,2022(03):304-311,315
A类：
teroviruses,N14S,L215P,M23L
B类：
年长,长春市,手足口病,肠道病毒,VP1,基因特征分析,hand,foot,mouth,disease,HFMD,en,A71,EV,流行规律,防控策略,建系,系统进化树,氨基酸变异,变异位点,共获,柯萨奇病毒,coxsackievirus,A16,CV,A6,A10,部属,B1a,B1b,序列同源性,毒株,D3,D2,氨基酸位点,点变异,天冬酰胺,丝氨酸,主要优势,稳定流,基因型别
AB值：
0.233249
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