典型文献
南京地区诺如病毒GII.4Sydney2012[P16]分子生物学特征研究
文献摘要:
2016年1月-2021年12月,南京市急性胃肠炎暴发主要由GII.2[P16]引起,但2021年11月底,由GII.4 Sydney2012[P16]引起的暴发显著上升.为了解GII.4 Sydney2012[P16]分子生物学特性,对监测期间204起急性胃肠炎暴发中收集到的3 129份样本进行荧光定量PCR检测,检出1006份诺如病毒阳性样本,对部分阳性样进行一步法RT-PCR扩增、测序,共检出10种GII型诺如病毒,随机选取19株GII.4Sydney2012[P16],结合7株GII.4 Sydney2012[P31]、31株GII.2[P16]南京株及2015-2021年国内外参考株进行序列比对和进化分析.19株GII.4 Syd1ney2012[P16]同源性达99.7%~100.0%,与参考株同源性达96.6%~99.3%.进化树分析显示,GII.P16虽与不同GII型诺如病毒组合,但进化距离上并未发生较大变化.与不同聚合酶区结合的GII.4 Sydney 2012在同一分支上,GII.4 Sydney 2012[P16]在进化距离上与 GII.4 Sydney 2012[P4 NewOrleans2009]更为接近.P2 区的 A、B、D和NERK位点均发生改变,所有GII.4的373氨基酸残基处均检测到显著的阳性选择.GII.P16虽未发生较大改变,但通过与GII.4Sydney2012重组,呈现加速在人群中流行的分子特征.而GII.4 Sydney2012通过改变抗原表位位点影响了抗原性和配体结合特性,显著促进了病毒的传播.因此GII.4Sydney2012[P16]是否会取代GII.2[P16]成为南京地区流行株,抑或被其他GⅡGII.4所替代,今后需要对更为广泛的潜在感染人群进行监测,及早发现早期新型诺如病毒.
文献关键词:
诺如病毒;急性胃肠炎暴发;基因型别
中图分类号:
作者姓名:
王璇;雍玮;刘品;斯佳丽;龚红瑾;丁洁
作者机构:
南京市疾病预防控制中心,南京210003
文献出处:
引用格式:
[1]王璇;雍玮;刘品;斯佳丽;龚红瑾;丁洁-.南京地区诺如病毒GII.4Sydney2012[P16]分子生物学特征研究)[J].病毒学报,2022(06):1305-1314
A类:
4Sydney2012,Sydney2012,Syd1ney2012,NewOrleans2009,NERK
B类:
南京地区,诺如病毒,GII,P16,分子生物学特征,急性胃肠炎暴发,月底,生物学特性,病毒阳性,阳性样本,一步法,共检出,P31,序列比对,进化分析,同源性,进化树分析,病毒组,进化距离,同聚,P4,P2,氨基酸残基,性选择,中流,分子特征,抗原表位,抗原性,配体结合特性,抑或,早发现,基因型别
AB值:
0.197163
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。