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2019年河南省1E基因型风疹病毒结构蛋白基因特征分析
文献摘要：
目的 分析2019年河南省1E基因型风疹病毒分离株结构蛋白基因特征,探讨抗原位点变异情况,为河南省风疹防控提供支持.方法 对河南省2019年风疹病毒分离株采用RT-PCR方法扩增结构蛋白基因片段并测序,截取C、E2、E1蛋白序列,使用Mega7.0.26软件进行进化树分析、同源性分析和氨基酸特征分析.结果 对5株1E基因型风疹病毒开展研究,扩增结构蛋白基因片段全长3 189 bp,同源性分析显示,分离株C、E2、E1蛋白核苷酸序列平均遗传距离分别为0.004、0.002和0.002;与疫苗株(Rubella virus strain BRD-Ⅱ)序列比较发现,发生氨基酸变异数分别为9个、15个和4个,与抗原相关的位点中,C蛋白103和116位点发生变异,E2蛋白173位点发生变异,E1蛋白333和338位点发生变异,其余关键位点未变异.结论 2019年河南省1E基因型风疹病毒株结构蛋白基因中糖基化位点保持稳定,但与细胞免疫相关氨基酸位点发生变异.
文献关键词：
风疹病毒;结构蛋白;基因特征;河南省
中图分类号：
作者姓名：
丰达星;王文慧;李光伟;吕宛玉;肖占沛;张延炀
作者机构：
河南省疾病预防控制中心免疫预防与规划所,河南郑州450016;河南省免疫预防医学重点实验室
文献出处：
引用格式：
[1]丰达星;王文慧;李光伟;吕宛玉;肖占沛;张延炀-.2019年河南省1E基因型风疹病毒结构蛋白基因特征分析)[J].河南预防医学杂志,2022(04):245-249
A类：
Rubella
B类：
1E,基因型,风疹病毒,结构蛋白,基因特征分析,病毒分离,分离株,抗原位点,点变异,变异情况,截取,E2,E1,Mega7,进化树分析,同源性分析,全长,bp,遗传距离,疫苗株,virus,strain,BRD,序列比较,氨基酸变异,异数,点中,关键位点,未变,毒株,糖基化位点,细胞免疫,免疫相关,氨基酸位点
AB值：
0.30899
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