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典型文献
2018-2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究
文献摘要:
目的 分析2018-2019年北京市西城区6所学校发生的急性胃肠炎疫情GⅠ诺如病毒的基因型别特征.方法 收集2018-2019年西城区6所学校急性胃肠炎病例的粪便标本37份.采用实时荧光定量反转录聚合酶链式反应(real-time RT-PCR)对提取的G Ⅰ和GⅡ诺如病毒核酸进行检测.采用RT-PCR进行G Ⅰ诺如病毒聚合酶区和衣壳蛋白VP1区部分片段的扩增和测序.用诺如病毒在线分型工具对测序成功的毒株进行初步鉴定和基因分型,用BioEdit 7.0.9.0软件进行序列比对,用MEGA 6.06软件构建进化树.结果 6所学校(18,S1~S4和19,S5~S6)发生的诺如病毒急性胃肠炎疫情均为聚集性疫情,G Ⅰ诺如病毒核酸阳性率为83.78%(31/37),GⅡ诺如病毒未检出;聚合酶区和衣壳蛋白VP1区进化分析分别显示,1起疫情的4株诺如病毒毒株分别与G Ⅰ.Pd参考株和G Ⅰ.3b参考株在同一分支,5起疫情的19株诺如病毒毒株与G Ⅰ.Pb参考株和G Ⅰ.6a参考株在同一分支;每所学校毒株相似性为100.0%.双区分型合并结果,1起疫情由G Ⅰ.Pd-G Ⅰ.3b引起,该重组株与G Ⅰ.3[P13]/Hu/MT008455/2018/Shanghai/CHI 相似性高达 99.6%;5 起疫情由 G Ⅰ.Pb-G Ⅰ.6a 引起,这重组株与G Ⅰ.6[P11]/Hu/MZ227264/2016/US相似性高达98.1%.结论 2018-2019年北京市西城区6所学校诺如病毒急性胃肠炎聚集性疫情分别由G Ⅰ.Pd-G Ⅰ.3b和G Ⅰ.Pb-G Ⅰ.6a重组株引起.应加强对诺如病毒重组株分子流行病学监测,为诺如病毒疫情提供预警预测的依据.
文献关键词:
诺如病毒;急性胃肠炎;重组株
作者姓名:
王永全;崔海洋;吉彦莉;靳博;李伟红;刘白薇;沈玲羽;高志勇;严寒秋
作者机构:
北京市西城区疾病预防控制中心,北京100120;北京市疾病预防控制中心/食物中毒诊断溯源技术北京市重点实验室,北京100013
文献出处:
引用格式:
[1]王永全;崔海洋;吉彦莉;靳博;李伟红;刘白薇;沈玲羽;高志勇;严寒秋-.2018-2019年北京市西城区6起学校急性胃肠炎聚集性疫情的GⅠ诺如病毒病原鉴定与溯源研究)[J].疾病监测,2022(06):769-776
A类:
MT008455,MZ227264
B类:
西城区,急性胃肠炎,聚集性疫情,诺如病毒,病毒病,病原鉴定,溯源研究,所学,基因型别,粪便标本,反转录聚合酶链式反应,real,病毒核酸,衣壳蛋白,VP1,分片,基因分型,BioEdit,序列比对,MEGA,软件构建,进化树,S1,S4,S5,S6,未检,进化分析,病毒毒株,Pd,3b,Pb,6a,双区,情由,重组株,P13,Hu,Shanghai,CHI,P11,US,情分,病毒重组,分子流行病学,学监,预警预测
AB值:
0.285187
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