典型文献
两株GI.1型札如病毒全基因组测序及初步分析
文献摘要：
目的:对GI.1型札如病毒进行全基因组扩增测序尝试并开展初步分析。方法:利用本研究设计的GI组札如病毒全基因组5’末端通用引物及杯状病毒3’末端引物，对本实验室保存的两株GI.1型札如病毒标本进行全基因组扩增，然后进行文库构建、上机测序及序列组装。通过BioEdit软件进行序列比对分析，采用MEGA 7.0软件构建进化树进行进化分析。结果:两个标本测序质量优异，测序方法具有可行性；在全基因组（WGS）、NSP基因、VP1基因及VP2基因进化树中，均归类为GI.1型；位点变异分布于各个基因片段，但VP1基因的N端保守性较好，熵值较低；大部分基因的核苷酸突变尤其是NS3、NS5及VP1基因的核苷酸突变以同义突变为主，未形成相应氨基酸的突变。结论:成功地开展了对GI.1型札如病毒全基因组扩增测序及相关进化分析，为札如病毒的检测提供了新的思路。
文献关键词：
札如病毒;全基因组;进化树;同义突变
中图分类号：
作者姓名：
蒋翠莲;曹雪;艾静;付建光
作者机构：
南京医科大学附属妇产医院 南京市妇幼保健院检验科 210004;南京医科大学免疫学教研室 211166;江苏省疾病预防控制中心急性传染病防制所 210009
文献出处：
引用格式：
[1]蒋翠莲;曹雪;艾静;付建光-.两株GI.1型札如病毒全基因组测序及初步分析)[J].国际病毒学杂志,2022(05):408-411
A类：
B类：
两株,GI,札如病毒,全基因组测序,初步分析,全基因组扩增,通用引物,杯状病毒,文库构建,上机,BioEdit,序列比对,比对分析,MEGA,软件构建,进化分析,WGS,NSP,VP1,VP2,基因进化树,点变异,保守性,核苷酸突变,NS3,NS5,同义突变,关进
AB值：
0.298533
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