首站-论文投稿智能助手
典型文献
2020—2021年安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型多样性分析
文献摘要:
目的:了解安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型别分布和进化特征。方法:收集2020年5月至2021年4月急性胃肠炎聚集性疫情病例诺如病毒核酸阳性肛拭子标本,荧光定量PCR分型检测诺如病毒GI和GII基因组,采用RT-PCR扩增GI组诺如病毒聚合酶区(RNA-dependent RNA polymerase,RdRp)和VP1区部分基因片段并测序。运用诺如病毒在线分型工具鉴定基因型别,利用MEGA 6.0软件构建RdRp和VP1区基因系统进化树。结果:45起疫情142份诺如病毒核酸阳性标本中检出23份为GI阳性,占19%(23/142);119份为GII阳性,占81%(119/142)。20份GI阳性标本PCR扩增产物测序成功。获取的20株诺如病毒RdRp-VP1区序列有6种分型,包括2株GI.1[P1]、2株GI.3[P10]、5株GI.3[P13]、2株GI.4[P4]、7株GI.5[P4]、2株GI.6[P11]。系统进化树显示:GI.1[P1]型安徽株与韩国株(MZ021974)、法国株(MK956173)同属一个进化分支;GI.3[P10]和GI.3[P13]型安徽株与中国台湾株(MN922742)、四川株(MW255366)、韩国株(MZ022026)进化距离较近;GI.4[P4]和GI.5[P4]型安徽株与2019年湖南株(MN938461)、2021年广东株(OK562729)处于一个进化分支;GI.6[P11]型安徽株独立为一个进化簇,与陕西株(MW243609)、日本株(LC646339)进化距离较近。结论:安徽省急性胃肠炎GI组诺如病毒基因型分布呈多样性,有必要开展感染性腹泻疫情分子溯源监测。
文献关键词:
诺如病毒;急性胃肠炎;基因型;进化特征
作者姓名:
史永林;傅荔艳;金晶;葛盈露;王鹏;程鹏;张文艳;孙永
作者机构:
安徽省疾病预防控制中心 安徽省公共卫生研究院微生物检验室,安徽省医疗卫生重点专科病原微生物分子生物学实验室,合肥 230601;安徽医科大学公共卫生学院卫生检验与检疫学系,合肥 230032;合肥市疾病预防控制中心微生物检验科,230061;黄山市疾病预防控制中心检验科,245000
文献出处:
引用格式:
[1]史永林;傅荔艳;金晶;葛盈露;王鹏;程鹏;张文艳;孙永-.2020—2021年安徽省急性胃肠炎疫情中GI组诺如病毒基因型多样性分析)[J].国际病毒学杂志,2022(02):103-108
A类:
MZ021974,MK956173,MN922742,MW255366,MZ022026,MN938461,OK562729,MW243609,LC646339
B类:
急性胃肠炎,诺如病毒,病毒基因,多样性分析,基因型别,进化特征,聚集性疫情,病毒核酸,肛拭子标本,分型检测,GII,dependent,polymerase,RdRp,VP1,工具鉴定,MEGA,软件构建,系统进化树,阳性标本,扩增产物,列有,P10,P13,P4,P11,同属,进化分支,中国台湾,进化距离,立为,进化簇,基因型分布,感染性腹泻,情分,分子溯源,溯源监测
AB值:
0.242031
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。