典型文献
我国重组型GII.2[P16]诺如病毒进化动力学和传播模式
文献摘要：
目的:2016年冬季出现了一种重组型GII.2[P16]诺如病毒（norovirus，NoV），并造成了我国急性胃肠炎大规模暴发，本研究旨在探究2016—2017年该病毒在我国的进化动力学和时空传播模式。方法:利用MEGA 7.0和BEAST等软件对先前获得的暴发标本中GII.2[P16] NoV全基因组、主要结构蛋白（viral protein 1，VP1）和RNA依赖RNA聚合酶（RNA-dependent RNA polymerase，RdRp）基因全编码区序列进行分析。结果:序列分析显示此次重组型病毒VP1相比于RdRp基因的进化速度更快，在暴发中期，VP1蛋白的第256位出现了特异性氨基酸突变，即Val256Ile突变，且该突变位点形成的新型变异株在暴发后期成为优势流行株。基于该毒株P二聚体晶体结构的分析，发现该病毒VP1蛋白中第256位残基位点可能参与了B细胞抗原表位的组成，提示Val256Ile突变可能导致了新型变异株的抗原性发生改变，这可能是该病毒在暴发后期优势流行的原因之一，但需要进一步血清学实验的验证。基于贝叶斯地理推演结果显示，广东省可能为我国此次病毒流行的起源地，对该病毒在我国的暴发流行起了重要的作用。结论:鉴于出现功能性改变的GII.2[P16]新型变异株和广东省为我国该型病毒的暴发中心，提示有必要在珠江三角洲地区对GII.2[P16] NoV开展持续的监测和研究。
文献关键词：
诺如病毒;进化动力学;传播模式
中图分类号：
作者姓名：
敖元云;徐锦;段招军
作者机构：
国家儿童医学中心复旦大学附属儿科医院临床检验医学中心，上海 201102;中国疾病预防控制中心病毒病预防控制所，北京 100052
文献出处：
引用格式：
[1]敖元云;徐锦;段招军-.我国重组型GII.2[P16]诺如病毒进化动力学和传播模式)[J].国际病毒学杂志,2022(02):98-102
A类：
Val256Ile
B类：
GII,P16,诺如病毒,病毒进化,进化动力学,传播模式,norovirus,NoV,急性胃肠炎,MEGA,BEAST,先前,发标,全基因组,主要结构,结构蛋白,viral,protein,VP1,dependent,polymerase,RdRp,编码区,序列分析,氨基酸突变,突变位点,新型变异株,优势流,毒株,二聚体,体晶,晶体结构,残基,抗原表位,抗原性,血清学,推演,起源地,暴发流行,珠江三角洲地区
AB值：
0.336156
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