典型文献
马铃薯StPEBP基因家族成员鉴定及其在块茎中的表达分析
文献摘要：
马铃薯作为世界上主要的粮食作物之一,其营养价值高,抗逆性强,在全球各地广泛种植.磷脂酰乙醇胺结合蛋白(Phosphatidyl ethanolamine-binding protein,PEBP)家族成员StSP6A和StSP5G在块茎形成中起着重要作用,但其他StPEBP家族基因成员在块茎形成中的作用尚未解析.研究利用拟南芥PEBP基因家族蛋白序列在马铃薯全基因组内进行Blastp比对,并对马铃薯StPEBP基因家族的保守基序、基因结构、顺式作用元件、染色体位置、共线性关系以及该家族在不同组织中特别是块茎发育中的表达模式进行分析.马铃薯StPEBP基因家族成员共有10个基因,该家族大部分成员含有4个外显子和3个内含子以及保守基序motif 5.系统进化分析表明StPEBP家族基因分为4个亚家族.顺式作用元件预测发现StPEBP家族基因含有大量光响应、激素响应和防御及应激反应元件.染色体定位分析发现StPEBP家族基因定位在6条染色体上,共线性分析检测到马铃薯中2对StPEBP基因间为重复基因.非同义/同义置换率的比率说明马铃薯StPEBP基因家族受到了纯化选择.qRT-PCR结果表明,StPEBP家族基因是诱导马铃薯块茎形成的潜在调控分子.研究结果可为进一步开展马铃薯结薯性状基因的筛选提供理论参考.
文献关键词：
马铃薯;块茎形成;StPEBP;基因家族;表达
中图分类号：
作者姓名：
张文哲;荐红举;尚丽娜;张梅花;王季春;Ahmed Mahmoud;吕典秋
作者机构：
西南大学农学与生物科技学院,重庆 400715;薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室,重庆 400715;Department of Vegetable Crops, Faculty of Agriculture, Cairo University, Giza 12613, Egypt
文献出处：
引用格式：
[1]张文哲;荐红举;尚丽娜;张梅花;王季春;Ahmed Mahmoud;吕典秋-.马铃薯StPEBP基因家族成员鉴定及其在块茎中的表达分析)[J].中国马铃薯,2022(02):97-110
A类：
StPEBP,Phosphatidyl,StSP6A,StSP5G,结薯性状
B类：
基因家族,成员鉴定,表达分析,粮食作物,营养价值,抗逆性,地广,磷脂酰乙醇胺,结合蛋白,ethanolamine,binding,protein,块茎形成,家族基因,研究利用,拟南芥,全基因组,Blastp,保守基序,基因结构,顺式作用元件,不同组织,块茎发育,表达模式,外显子,内含子,motif,系统进化分析,亚家族,光响应,激素响应,应激反应,反应元件,染色体定位,定位分析,基因定位,共线性分析,分析检测,非同,同义,置换率,qRT,马铃薯块茎
AB值：
0.260908
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