典型文献
马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆
文献摘要:
将拟南芥AtASR基因核苷酸序列作为查询序列,在NCBI数据库中进行BLAST比对,得到马铃薯StASR基因(GenBank登录号:XM_006359742)的序列.通过生物信息学分析发现,该基因位于4号染色体上,基因长度为654 bp,编码108个氨基酸残基,其编码的蛋白质具有典型的ABA/WDS保守结构域.启动子区域分析后发现,马铃薯StASR基因含有水分响应元件MYCATERD1、冷胁迫响应元件DRECRTCOREAT和盐胁迫响应元件GT1GMSCAM4等多种与非生物胁迫响应相关元件以及马铃薯生长发育相关顺式作用元件,对其进行蛋白质互作网络的分析发现与低温、水分胁迫等基因互作.用PCR技术成功的克隆到马铃薯StASR基因,其结果可以为深入研究马铃薯StASR基因的功能提供基础.
文献关键词:
ASR基因;干旱胁迫;马铃薯;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
王树林;李高峰;张荣;文国宏;李建武
作者机构:
甘肃省农业科学院马铃薯研究所,甘肃 兰州 730070;国家农业科学种质资源渭源观测实验站,甘肃 渭源 748201
文献出处:
引用格式:
[1]王树林;李高峰;张荣;文国宏;李建武-.马铃薯StASR基因的生物信息学分析及基因克隆)[J].寒旱农业科学,2022(03):20-24
A类:
StASR,AtASR,MYCATERD1,DRECRTCOREAT,GT1GMSCAM4
B类:
马铃薯,生物信息学分析,基因克隆,拟南芥,列作,NCBI,BLAST,GenBank,登录号,XM,bp,氨基酸残基,ABA,WDS,保守结构域,启动子区域,区域分析,响应元,冷胁迫响应,盐胁迫,非生物胁迫,关元,顺式作用元件,蛋白质互作网络,水分胁迫,基因互作,干旱胁迫
AB值:
0.274638
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