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典型文献
干旱-复水处理下差异表达玉米WRKY基因的鉴定与分析
文献摘要:
为了挖掘玉米抗旱相关WRKY转录因子,对干旱-复水处理下差异表达的玉米WRKY基因进行鉴定,并对其蛋白质理化性质、系统进化、染色体分布和复制关系、基因结构和蛋白质保守基序、启动子区顺式作用元件及干旱-复水条件下的表达量等进行分析.结果表明,共鉴定筛选出51个差异表达的玉米WRKY基因,编码氨基酸数目介于99~729个,分子质量介于11.22~78.73 ku,等电点介于4.58~12.26;WRKY基因分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ组,其中Ⅱ又分为Ⅱa、Ⅱb、Ⅱc、Ⅱd、Ⅱe 5个亚组;WRKY基因不均等分布在10条染色体上,存在2对串联复制和16对片段复制;外显子数目为1~12个,大部分WRKY基因(41个)含有2~4个保守基序,且同一组中的WRKY成员具有相似的基序组成;启动子区含有ABRE、AuxRR-core、TCA-element、TC-rich repeats TGACG-motif、LTR、MBS、TATC-box、P-box、CGTCA-motif、GC-motif、TGA-element、GARE-motif等植物激素及非生物胁迫相关的顺式作用元件.干旱-复水处理下,51个玉米WRKY基因呈现出不同表达模式,其中ZmWRKY1、ZmWRKY10、ZmWRKY16、ZmWRKY28、ZmWRKY30、ZmWRKY33、ZmWRKY42、ZmWRKY65、ZmWRKY68、ZmWRKY78、ZmWRKY96、ZmWRKY99、ZmWRKY100、ZmWRKY102和ZmWRKY111等15个基因正向响应干旱胁迫,ZmWRKY87负向响应干旱胁迫,它们是今后深入研究玉米WRKY家族响应干旱的候选基因.
文献关键词:
玉米;WRKY转录因子;系统进化;干旱;基因表达
作者姓名:
付家旭;闫亚丽;谢小文;张心悦;温鹏飞;关小康;王同朝;卫丽
作者机构:
河南农业大学农学院,河南郑州450002
文献出处:
引用格式:
[1]付家旭;闫亚丽;谢小文;张心悦;温鹏飞;关小康;王同朝;卫丽-.干旱-复水处理下差异表达玉米WRKY基因的鉴定与分析)[J].河南农业科学,2022(08):9-19
A类:
AuxRR,TATC,ZmWRKY1,ZmWRKY10,ZmWRKY16,ZmWRKY28,ZmWRKY30,ZmWRKY33,ZmWRKY42,ZmWRKY65,ZmWRKY68,ZmWRKY78,ZmWRKY96,ZmWRKY99,ZmWRKY100,ZmWRKY102,ZmWRKY111,ZmWRKY87
B类:
复水处理,差异表达,抗旱,旱相,系统进化,基因结构,质保,保守基序,启动子区,顺式作用元件,复水条件,分子质量,ku,等电点,外显子,ABRE,core,element,rich,repeats,TGACG,motif,LTR,MBS,box,CGTCA,GARE,植物激素,非生物胁迫,表达模式,干旱胁迫,候选基因
AB值:
0.21934
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