典型文献
玉米miR395基因家族生物信息学分析及靶基因预测
文献摘要:
MicroRNA(miRNA)具有调控基因表达的作用,为了揭示玉米miR395基因家族进化规律、表达模式及功能,开展了基因定位、多序列比对、顺式作用元件分析、二级结构分析、靶基因预测及表达模式分析.结果共鉴定到16个成员,且均集中分布在第2号、第10号染色体上;19个碱基完全相同,表明在进化过程中具有高度保守性;具有18个ABRE类顺式作用元件,推测其通过参与调节ABA信号传导,提高玉米抗逆性;多数靶向基因参与硫酸盐同化,初步推测玉米miR395基因家族参与玉米硫代谢;转录组分析发现zma-miR395基因家族中一些成员为下调表达模式.研究结果为后续玉米相关基因的功能解析奠定了基础.
文献关键词:
玉米;miR395基因家族;生物信息学分析;靶基因;表达模式
中图分类号:
作者姓名:
王丽;路运才
作者机构:
黑龙江大学现代农业与生态环境学院,哈尔滨150080;黑龙江省肇东市农业技术推广中心,黑龙江肇东151100
文献出处:
引用格式:
[1]王丽;路运才-.玉米miR395基因家族生物信息学分析及靶基因预测)[J].中国农学通报,2022(14):30-37
A类:
miR395,zma
B类:
基因家族,生物信息学分析,靶基因预测,MicroRNA,miRNA,调控基因,家族进化,进化规律,基因定位,多序列比对,顺式作用元件,二级结构,表达模式分析,碱基,完全相同,保守性,ABRE,ABA,信号传导,抗逆性,硫酸盐,家族参与,硫代谢,转录组分析,功能解析
AB值:
0.314183
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