典型文献
马蓝WRKY转录因子家族生物信息学及表达特征分析
文献摘要:
WRKY转录因子是植物中一类保守的转录因子,在植物生长发育和次生代谢过程中发挥重要的调控作用.本研究对马蓝(Baphicacanthus cusia)不同组织(根、茎和叶)的转录组数据进行分析,共鉴定了 65个马蓝WRKY(BcWRKY)家族成员.其编码氨基酸长度约为221~706 aa,等电点为4.68~9.68,分子质量为25 711.8~75 475 Da,二级结构主要为无规则卷曲,亚细胞定位预测显示多数BcWRKYs定位在细胞核中.系统进化分析将其分为3大族,其中第二大族(Group Ⅱ)又可分为5个亚族(Group Ⅱa、Group Ⅱb、Group Ⅱc、Group Ⅱd和Group Ⅱe).结构域分析显示BcWRKY均含有高度保守的WRKYGQK基序.利用实时荧光定量PCR(RT-PCR)对马蓝根、茎和叶中高表达的10个WRKY基因进行检测,发现均可响应脱落酸(abscisic acid,ABA)、茉莉酸甲酯(methyl jasmonate,MeJA)和水杨酸(salicylic acid,SA)的诱导.本研究为进一步阐明马蓝中吲哚生物碱生物合成中WRKY转录因子的分子机制提供基础.
文献关键词:
马蓝;WRKY转录因子;生物信息学;表达分析;吲哚生物碱
中图分类号:
作者姓名:
郭志英;李卿;吴循循;陈军峰;黄玉香;马晓娟;刁勇;张磊
作者机构:
福建技术师范学院食品与生物工程学院,福建福清350300;中国人民解放军海军军医大学药学院,上海200433;中国人民解放军海军军医大学第二附属医院药剂科,上海200003;华侨大学医学院,福建泉州362021;上海中医药大学中药研究所,上海201203;泉州医学高等专科学校药学院,福建泉州362000;泉州市农业科学研究所,福建泉州362212
文献出处:
引用格式:
[1]郭志英;李卿;吴循循;陈军峰;黄玉香;马晓娟;刁勇;张磊-.马蓝WRKY转录因子家族生物信息学及表达特征分析)[J].药学学报,2022(09):2864-2875
A类:
Baphicacanthus,cusia,BcWRKY,BcWRKYs
B类:
马蓝,表达特征,植物生长发育,次生代谢,代谢过程,不同组织,转录组数据,aa,等电点,分子质量,Da,二级结构,无规则,卷曲,亚细胞定位,定位预测,细胞核,系统进化分析,大族,Group,结构域,WRKYGQK,基序,脱落酸,abscisic,acid,ABA,茉莉酸甲酯,methyl,jasmonate,MeJA,水杨酸,salicylic,SA,吲哚生物碱,生物合成,表达分析
AB值:
0.329317
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