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黄花蒿Dof基因家族鉴定及在GA-UV处理下对青蒿素生物合成的影响
文献摘要：
目的 Dof(DNA binding with one finger)家族是高等植物中特有的一类转录因子家族,参与植物中光、激素、非生物胁迫等多种胁迫响应调控.本研究基于全基因组数据对黄花蒿Dof(AaDof)转录因子家族进行鉴定及表达模式分析,探究Dof家族基因在青蒿素合成调控中的作用.方法 经PFAM数据库鉴定获得AaDof序列,通过生物信息学软件分析其理化性质、亚细胞定位、基因结构、蛋白保守结构以及启动子序列结合元件等,并基于赤霉素(Gibberellic acid,GA)、紫外线B(UV-B)及二者协同胁迫下黄花蒿转录组数据对其表达模式进行分析.结果 本研究从全基因组水平共鉴定出51个AaDof基因,均含有保守的C2-C2单锌指结构,依据系统发育分析分为8个亚族,同一亚族内基因结构与蛋白保守结构域相对保守.亚细胞定位预测显示12个AaDof蛋白定位在细胞外,其余均定位在细胞核.启动子元件分析发现AaDof家族基因启动子区富含光、激素等多种响应元件.对AaDof在GA、UV-B和GA+UV-B处理下的表达模式分析发现,AaDof基因对GA胁迫处理响应较弱,仅有少量基因敏感,其表达主要受到UV-B胁迫影响.C1及C2.1亚族大部分基因在UV-B胁迫下上调表达,而A亚族大部分基因在UV-B胁迫下下调表达.qRT-PCR验证表明AaDof1、AaDof17和AaDof44在GA和UV-B处理下表达量显著上调,推测其可能通过参与GA和UV-B调控网络,正向调控青蒿素生物合成.结论 本研究系统鉴定了黄花蒿AaDof家族基因并筛选了3个可能正向调控青蒿素生物合成的候选AaDof基因,为黄花蒿Dof家族基因功能研究及其在青蒿素生物合成中的调控机制解析奠定基础.
文献关键词：
黄花蒿;Dof转录因子;青蒿素;紫外线B;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
王星文;邬兰;马婷玉;尹青岗;师玉华;向丽
作者机构：
中药鉴定与安全性评估重点实验室/中国中医科学院中药研究所 北京 100700
文献出处：
引用格式：
[1]王星文;邬兰;马婷玉;尹青岗;师玉华;向丽-.黄花蒿Dof基因家族鉴定及在GA-UV处理下对青蒿素生物合成的影响)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1825-1837
A类：
AaDof,GA+UV,AaDof1,AaDof17,AaDof44
B类：
黄花蒿,基因家族鉴定,青蒿素,生物合成,binding,one,finger,高等植物,非生物胁迫,胁迫响应,响应调控,全基因组,基因组数据,表达模式分析,家族基因,合成调控,PFAM,生物信息学软件,亚细胞定位,基因结构,启动子序列,赤霉素,Gibberellic,acid,紫外线,协同胁迫,转录组数据,C2,锌指,系统发育分析,保守结构域,定位预测,蛋白定位,细胞核,基因启动子区,响应元,胁迫处理,C1,下下,qRT,调控网络,研究系统,系统鉴定,基因功能,功能研究,调控机制,机制解析,表达分析
AB值：
0.250247
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