典型文献
穿心莲R2R3-MYB基因家族的鉴定与表达分析
文献摘要：
R2R3-MYB是一类调控植物生长发育及次生代谢的重要转录因子.利用生物信息学手段从穿心莲全基因组中鉴定R2R3-MYB基因,分析其理化性质、染色体定位信息、基因结构和保守序列信息、系统进化信息及启动子区域的顺式作用元件.结合转录组测序技术和qRT-PCR分析其在非生物胁迫和激素诱导下的表达谱.结果 表明,穿心莲R2R3-MYB基因家族含有73个成员,分为34个亚家族C1～C34,其中19个归类于已知的拟南芥亚家族;73个成员不均一的分布在穿心莲的21条染色体上;蛋白的长度为148～887 aa,其中有36个偏酸性和37个偏碱性R2R3-MYB蛋白;穿心莲R2R3-MYB的结构域、motifs和基因结构相对保守;基因上游启动子区域含有光、茉莉酸甲酯、脱落酸和干旱等多种胁迫和激素响应元件,表明穿心莲R2R3-MYB可能会受到环境胁迫和激素的诱导;结合转录差异表达谱和同一亚家族功能保守性,推测ApMYB13/21/35/67/73 (S22)基因可能通过ABA依赖途径调控干旱胁迫,ApMYB20(S11)和ApMYB55 (S2)可能参与穿心莲高温和UV-C胁迫,ApMYB5(S7)和ApMYB33 (S20)可能通过调控MEP途径中的关键酶的表达,影响穿心莲内酯的积累.该研究为深入研究穿心莲R2R3-MYB基因家族的功能和选育高穿心莲内酯含量的品种提供理论参考.
文献关键词：
穿心莲;R2R3-MYB基因家族;非生物胁迫;穿心莲内酯;功能预测
中图分类号：
作者姓名：
李静宇;孙铭阳;徐世强;孙伟;顾艳;梅瑜;王继华
作者机构：
广东省农业科学院作物研究所广东省农作物遗传改良重点实验室,广东广州510640;中国中医科学院中药研究所,北京100700
文献出处：
引用格式：
[1]李静宇;孙铭阳;徐世强;孙伟;顾艳;梅瑜;王继华-.穿心莲R2R3-MYB基因家族的鉴定与表达分析)[J].中国中药杂志,2022(01):72-84
A类：
ApMYB13,ApMYB20,ApMYB55,ApMYB5,ApMYB33
B类：
R2R3,基因家族,表达分析,植物生长发育,次生代谢,利用生物,全基因组,染色体定位,定位信息,基因结构,保守序列,序列信息,系统进化,启动子区域,顺式作用元件,转录组测序技术,qRT,非生物胁迫,激素诱导,表达谱,亚家族,C1,C34,拟南芥,均一,aa,结构域,motifs,茉莉酸甲酯,脱落酸,激素响应,响应元,环境胁迫,差异表达,保守性,S22,ABA,干旱胁迫,S11,UV,S7,S20,MEP,关键酶,穿心莲内酯,选育,功能预测
AB值：
0.269993
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
