典型文献
川白芷MYB-related家族的生物信息及表达模式分析
文献摘要：
近年来,研究发现MYB-related家族基因在植物的生长发育过程中起着重要作用.该文以"川芷2号"为供试材料,运用转录组数据库检索和生物信息学的方法系统分析白芷MYB-related家族基因,并通过实时荧光定量PCR对其时空表达特性进行分析.研究表明,共鉴定出122个MYB-related家族蛋白,主要为热稳定性良好的不稳定性亲水蛋白;大部分蛋白定位于细胞核中;该家族蛋白无规卷曲和α-螺旋所占比例较大;5个白芷MYB-related家族蛋白具有膜结合结构域;通过对白芷MYB-related家族蛋白保守结构域分析,5个亚组基因的MYB结构域与2R-、3R-和4R-MYB蛋白类似,含有MYB重复序列中3个均匀分布的Trp(W)残基.通过白芷和拟南芥MYB-related家族蛋白的系统进化分析显示,二者的MYB-related成员在5个亚组中均有不均匀分布,且在CCA1-like亚组中拟南芥和白芷具有几乎相同的基因数量;122条编码蛋白所含基序数量、类型、分布上存在差异,分支相近的转录因子具有相似的结构域及基序;表达模式分析显示AdMYB53、AdMYB83、AdMYB89转录因子对激素均有不同程度响应,且均在叶中表达量较高,根部响应迅速.该研究为进一步研究白芷MYB-related转录因子的功能及解决白芷早抽薹等生物学问题奠定了基础.
文献关键词：
白芷;MYB-related家族;生物信息学分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
姚菲;江美彦;杨云舒;杨雪梅;杜宣;刘仁浪;侯凯;吴卫
作者机构：
四川农业大学农学院, 四川温江 611130
文献出处：
引用格式：
[1]姚菲;江美彦;杨云舒;杨雪梅;杜宣;刘仁浪;侯凯;吴卫-.川白芷MYB-related家族的生物信息及表达模式分析)[J].中国中药杂志,2022(07):1831-1846
A类：
川白芷,AdMYB53,AdMYB83,AdMYB89
B类：
related,表达模式分析,家族基因,转录组数据,数据库检索,法系,时空表达,表达特性,热稳定性,亲水,蛋白定位,细胞核,无规,卷曲,结合结构,保守结构域,2R,3R,4R,重复序列,Trp,残基,拟南芥,系统进化分析,不均匀分布,CCA1,like,编码蛋白,所含,基序,序数,根部,抽薹,生物信息学分析,表达分析
AB值：
0.259691
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