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翼首草鲨烯合酶(PhSQS2)全长克隆、表达特性分析及蛋白功能验证
文献摘要：
目的 从匙叶翼首草Pterocephalus hookeri转录组中挖掘参与三萜合成的鲨烯合酶(squalene synthase,SQS)并研究其作用机制.方法 以翼首草基原植物匙叶翼首草为研究对象,基于前期转录组数据筛选克隆PhSQS2基因,并进行生物信息学分析;通过烟草瞬时转化实验观察PhSQS2亚细胞定位情况,利用实时荧光定量PCR分析PhSQS2在不同器官中的表达特征;构建原核表达载体经体外酶促反应鉴定PhSQS2功能.结果 PhSQS2基因开放阅读框(open reading frame,ORF)区域全长1242 bp编码414个氨基酸,蛋白相对分子质量为47 400,理论等电点为6.57,总平均疏水性为-0.075,为不稳定蛋白.PhSQS2主要定位在细胞核和细胞质中;组织分布具有特异性,在根和叶中均有表达,叶中表达量显著高于根中.体外酶促实验证明PhSQS2催化法尼基焦磷酸生成鲨烯.结论 PhSQS2的功能鉴定为解析翼首草中萜类物质生物合成途径,提高三萜皂苷类成分含量及优质种质资源筛选培育提供了前期理论基础.
文献关键词：
匙叶翼首草;翼首草;鲨烯合酶(PhSQS2);生物信息学;表达特性;基因功能
中图分类号：
作者姓名：
王芸;吴宇;蒋庆锋;何焱;兰小中;张磊
作者机构：
上海大学医学院生物医药创新研发中心,上海 200444;海军军医大学药学院药用植物学教研室,上海 200433;西藏军区总医院医疗保障中心药剂科,西藏拉萨 850000;西藏农牧学院西南大学药用植物联合研发中心,西藏林芝 860000
文献出处：
引用格式：
[1]王芸;吴宇;蒋庆锋;何焱;兰小中;张磊-.翼首草鲨烯合酶(PhSQS2)全长克隆、表达特性分析及蛋白功能验证)[J].中草药,2022(21):6840-6847
A类：
PhSQS2,匙叶翼首草,Pterocephalus,hookeri
B类：
鲨烯合酶,全长,表达特性,蛋白功能,功能验证,squalene,synthase,基原,转录组数据,数据筛选,生物信息学分析,烟草,瞬时转化,化实验,实验观察,亚细胞定位,不同器官,表达特征,原核表达载体,体外酶促反应,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,bp,白相,相对分子质量,等电点,疏水性,细胞核,细胞质,组织分布,焦磷酸,功能鉴定,萜类物质,生物合成途径,高三,三萜皂苷类,皂苷类成分,成分含量,种质资源筛选,基因功能
AB值：
0.288889
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