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白木香转录因子AsNAC2的克隆及表达分析
文献摘要：
目的 对珍稀南药沉香基原植物白木香Aquilaria sinensis AsNAC2转录因子进行分子克隆,并对其进行生物信息学和表达模式分析.方法 以白木香茎的总RNA反转录的cDNA为模板,采用PCR技术获取基因编码序列(coding sequence,CDS)全长;利用生物信息学软件预测蛋白的理化性质、结构域和亚细胞定位等特性;运用DNAMAN8.0和MEGA6.0等软件分别进行多序列比对和进化关系分析;利用qRT-PCR技术检测AsNAC2基因在不同组织和伤害胁迫下的表达特性.结果 克隆获得AsNAC2基因(GenBank注册号MT130201),开放阅读框(open reading frame,ORF)全长864 bp,编码1条由287个氨基酸组成的弱酸性的稳定的亲水性蛋白,该蛋白定位在细胞核中,不存在跨膜结构域.序列比对和系统进化树分析显示,AsNAC2蛋白N端具有典型的NAM结构域,与锦葵目中的可可、哥伦比亚锦葵和榴莲NAC 2-like蛋白亲缘关系近,属于NAC转录因子家族中的ATAF亚组.qRT-PCR结果显示,AsNAC2基因主要在健康白木香的根和茎中表达,全断干伤害可显著诱导茎中AsNAC2基因表达量的上调,在2h达到峰值,此后缓慢下降,至48 h基本恢复正常.结论 首次在白木香中克隆和鉴定了 AsM4C2基因,该基因易受伤害诱导表达,且在伤害早期相对应.
文献关键词：
白木香;转录因子;NAC;克隆;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
张玉秀;刘培卫;吕菲菲;杨云;徐艳红;高志晖;魏建和
作者机构：
中国医学科学院 北京协和医学院药用植物研究所海南分所 海南省南药资源保护与开发重点实验室 国家中医药管理局沉香可持续利用重点研究室,海南海口 570311;中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所中草药物质基础与资源利用教育部重点实验室濒危药材繁育国家工程实验室,北京 100193
文献出处：
引用格式：
[1]张玉秀;刘培卫;吕菲菲;杨云;徐艳红;高志晖;魏建和-.白木香转录因子AsNAC2的克隆及表达分析)[J].中草药,2022(15):4807-4812
A类：
AsNAC2,MT130201,AsM4C2
B类：
白木香,表达分析,珍稀,南药,沉香,基原,Aquilaria,sinensis,分子克隆,表达模式分析,cDNA,技术获取,基因编码,编码序列,coding,sequence,CDS,全长,利用生物,生物信息学软件,软件预测,亚细胞定位,DNAMAN8,MEGA6,多序列比对,进化关系,关系分析,qRT,不同组织,胁迫,表达特性,GenBank,注册号,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,bp,氨基酸组成,弱酸性,亲水性,蛋白定位,细胞核,跨膜结构域,系统进化树分析,锦葵,可可,哥伦比亚,榴莲,like,亲缘关系,ATAF,基因表达量,2h,慢下,受伤害,诱导表达
AB值：
0.369723
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