典型文献
钩吻GeERF转录因子的鉴定及在低温胁迫下的表达
文献摘要:
钩吻Gelsemium elegans因其日益凸显的药用价值遭受人为采挖破坏,导致野生钩吻储量减少.人工栽培钩吻药材成为趋势,但钩吻不耐低温,挖掘低温响应基因对钩吻抗逆育种具有重要意义.该研究基于4℃低温胁迫下的钩吻转录组数据库,挖掘获得29个受低温诱导差异表达的钩吻GeERF基因.对其中21个具有完整编码框的GeERF基因序列进行生物信息学分析,结果显示,GeERF蛋白聚类在DREB亚组和ERF亚组的成员数量分别为12、9个.GeDREB1A-1~GeERF6B-1蛋白相对分子质量为23.78~50.96 kDa,氨基酸长度212~459 aa,推测均为亲水性的核定位蛋白.进一步从钩吻叶片中克隆获得GeERF2B-1基因的cDNA全长序列.亚细胞定位结果显示,GeERF2B-1在细胞核上定位.实时荧光定量PCR(quantitative real-time PCR,qRT-PCR)分析表明,GeERF2B-1基因在钩吻的根、茎和叶中组成型表达,且在根中表达量最高.此外,经4℃处理后,相较于对照,GeERF2B-1基因的表达量在12 h显著升高且达到峰值,表明该基因积极响应低温胁迫.研究结果为钩吻GeERF转录因子的功能研究提供科学依据,并为钩吻品种的抗逆性改良提供潜在的基因资源.
文献关键词:
钩吻;ERF转录因子;序列分析;低温胁迫;表达分析
中图分类号:
作者姓名:
尤垂淮;刘安玉;张婷;赵亚菲;崔天真;谢津津;林海玲;阙友雄;苏亚春;阙万才
作者机构:
福建农林大学生命科学学院,福建福州350002;福建农林大学农业农村部福建甘蔗生物学与遗传育种重点实验室,福建福州350002;福建医科大学附属协和医院药学部,福建福州350001
文献出处:
引用格式:
[1]尤垂淮;刘安玉;张婷;赵亚菲;崔天真;谢津津;林海玲;阙友雄;苏亚春;阙万才-.钩吻GeERF转录因子的鉴定及在低温胁迫下的表达)[J].中国中药杂志,2022(18):4908-4918
A类:
GeERF,Gelsemium,GeDREB1A,GeERF6B,GeERF2B
B类:
钩吻,低温胁迫,elegans,药用价值,采挖,储量,人工栽培,不耐,耐低温,低温响应,响应基因,育种,转录组数据,差异表达,整编,基因序列,生物信息学分析,成员数,白相,相对分子质量,kDa,aa,亲水性,核定,cDNA,全长,亚细胞定位,定位结果,细胞核,quantitative,real,qRT,组成型表达,积极响应,功能研究,抗逆性,基因资源,序列分析,表达分析
AB值:
0.277886
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。