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典型文献
丹参酮生物合成相关SmERF108转录因子的鉴定及其靶基因分析
文献摘要:
目的 鉴定与丹参酮合成相关转录因子AP2/ERF家族中SmERF108转录因子,并分析转录因子SmERF108的靶基因.方法 利用生物信息学在线分析平台如NCBI、PFAM等分析SmERF108的序列特征;MEGA-X软件用于构建SmERF108与不同功能转录因子的系统进化树;拟南芥原生质体转化法鉴定SmERF108蛋白的亚细胞定位;通过实时荧光定量PCR(Real-time qPCR)对SmERF108基因在丹参不同器官和组织差异表达进行检测;利用酵母体系对SmERF108的转录激活活性进行探究并用酵母单杂技术确定其靶基因.结果 SmERF108具有典型的AP2/ERF保守结构域,属于ERF-B3亚组,系统进化树和保守基序分析显示SmERF108与丹参中SmERF128、青蒿中AaERF2亲缘关系较近且保守基序分布一致;亚细胞定位显示SmERF108蛋白定位于细胞核;SmERF108基因在周皮中表达最高,且呈现周皮(R1)>韧皮部(R2)>木质部(R3)的规律;酵母自激活验证SmERF108具有转录激活活性,同时酵母单杂交确认其能与关键酶基因SmCPS1启动子结合.结论 鉴定到丹参中一个新转录因子SmERF108,生物信息学分析及差异表达分析预测与丹参酮合成相关,分子互作初步证实靶基因为SmCPS1二萜环化酶.
文献关键词:
丹参;转录因子;丹参酮;靶基因分析
作者姓名:
卢芷梅;关睿;苏立蓉;姚薇;张李兵;陈珍珍;徐舜;段礼新;季爱加
作者机构:
广州中医药大学中药学院国际中医药转化医学研究所 广州 510006
引用格式:
[1]卢芷梅;关睿;苏立蓉;姚薇;张李兵;陈珍珍;徐舜;段礼新;季爱加-.丹参酮生物合成相关SmERF108转录因子的鉴定及其靶基因分析)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1885-1894
A类:
SmERF108,SmERF128,AaERF2,SmCPS1
B类:
丹参酮,生物合成,靶基因分析,AP2,利用生物,生物信息学在线分析,分析平台,NCBI,PFAM,序列特征,MEGA,系统进化树,拟南芥,原生质体,转化法,亚细胞定位,Real,qPCR,不同器官,组织差异表达,母体,转录激活活性,杂技,保守结构域,B3,保守基序,青蒿,亲缘关系,蛋白定位,细胞核,周皮,R1,韧皮部,木质部,R3,酵母自激活,酵母单杂交,关键酶基因,启动子,生物信息学分析,差异表达分析,分析预测,分子互作,二萜,环化酶
AB值:
0.281442
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