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典型文献
马尾松R2R3-MYB基因特征及进化和表达分析
文献摘要:
MYB类转录因子在植物生长发育、代谢、应答生物胁迫和非生物胁迫的响应等生物过程发挥重要作用.为探究马尾松R2R3-MYB基因结构及功能,该研究以转录组数据为研究区域,从中筛选获得了17个马尾松R2R3-MYB基因,利用生物信息学对基因进行理化性质、系统进化树等分析,同时利用荧光定量PCR技术分析基因的组织特异性以及在花发育时期和非生物胁迫下的表达模式.结果表明:(1)17个PmMYBs亚细胞定位于细胞核,均无跨膜结构,且均含有Motif1、Motif2保守基序.系统发育进化树将马尾松PmMYBs划分为9个亚家族,且与火炬松、白云杉等裸子针叶植物关系较近.(2)17个基因均属于组成型表达,但在不同组织的表达量不同;所有基因均参与了花发育和非生物胁迫,不同基因在花发育不同时期的表达存在差异,有7个基因可能参与了雌雄性状转变;大部分基因响应非生物胁迫上调表达,但响应胁迫的时间存在差异;少数基因在胁迫中下调表达,尤其是PmMYB11基因在所有胁迫中均明显下调表达.该研究较系统地分析了马尾松R2R3-MYB基因的结构特征、系统进化及其在花发育时期和非生物胁迫下的表达模式,为深入探究马尾松R2R3-MYB基因的功能及逆境响应机制提供了参考.
文献关键词:
马尾松;R2R3-MYB;生物信息学分析;非生物胁迫;基因表达
作者姓名:
孙爽;胡颖;陆晶宇;杨章旗;陈虎
作者机构:
广西壮族自治区林业科学研究院 国家林业和草原局马尾松工程技术研究中心/广西马尾松工程技术研究中心/广西优良用材林资源培育重点实验室,南宁530002;广西师范大学 生命科学学院,广西 桂林541006;广西大学 林学院,南宁530004
文献出处:
引用格式:
[1]孙爽;胡颖;陆晶宇;杨章旗;陈虎-.马尾松R2R3-MYB基因特征及进化和表达分析)[J].广西植物,2022(04):580-594
A类:
PmMYBs,Motif2,PmMYB11
B类:
马尾松,R2R3,基因特征,表达分析,植物生长发育,非生物胁迫,生物过程,基因结构,结构及功能,转录组数据,利用生物,系统进化树,组织特异性,花发育,发育时期,表达模式,亚细胞定位,细胞核,膜结构,Motif1,保守基序,系统发育进化树,亚家族,火炬松,白云,云杉,针叶,组成型表达,不同组织,雌雄,逆境响应,响应机制,生物信息学分析
AB值:
0.240119
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