典型文献
金线莲中调控胚胎发育WRKY转录因子筛选及克隆分析
文献摘要：
目的 探究金线莲Anoectochilus roxburghii中WRKY转录因子时空表达模式并筛选调控金线莲胚胎发育的ArWRKY基因.方法 基于金线莲转录组数据库进行ArWRKY转录因子筛选,利用软件进行蛋白质结构域预测、序列比对、理化性质预测与进化树构建等分析.采用实时荧光定量PCR(qRT-PCR)检测ArWRKY基因时空表达模式.根据转录组数据Unigenes克隆ArWRKY的CDS序列.结果 筛选得到金线莲中23条WRKY转录因子,分别命名为ArWRKY1～ArWRKY23;qRT-PCR结果表明ArWRKY5与ArWRKY20基因在金线莲叶芽期、花芽期及开花期的花中表达量都显著高于根、茎、叶;克隆得到ArWRKY5的CDS为600 bp,ArWRKY20的CDS为1149 bp.结论 筛选得到23个ArWRKY转录因子并成功克隆获得ArWRKY5与ArWRKY20的CDS序列,对探究ArWRKY转录因子调控金线莲生长发育及验证ArWRKY5与ArWRKY20基因功能奠定基础.
文献关键词：
金线莲;胚胎发育;WRKY转录因子;生物信息学分析;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
邢丙聪;苏立样;万思琦;邵清松
作者机构：
浙江省特色中药资源保护与创新利用重点实验室,浙江杭州 311300;浙江农林大学中药学科,浙江杭州 311300
文献出处：
引用格式：
[1]邢丙聪;苏立样;万思琦;邵清松-.金线莲中调控胚胎发育WRKY转录因子筛选及克隆分析)[J].中草药,2022(12):3745-3754
A类：
ArWRKY,ArWRKY1,ArWRKY23,ArWRKY5,ArWRKY20
B类：
金线莲,胚胎发育,因子筛选,Anoectochilus,roxburghii,时空表达模式,选调,转录组数据,利用软件,蛋白质结构域,域预测,序列比对,进化树构建,qRT,因时,Unigenes,CDS,选得,莲叶,叶芽,芽期,花芽,开花期,bp,基因功能,生物信息学分析
AB值：
0.202748
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