典型文献
黄草乌异戊烯基焦磷酸异构酶基因的克隆与功能研究
文献摘要：
目的 对黄草乌Aconitum vilmorinianum的异戊烯基焦磷酸异构酶(isopentenyl diphosphate isomerase,IDI)基因进行克隆及功能研究,为黄草乌中二萜生物碱的生物合成途径解析奠定基础.方法 基于黄草乌的转录组数据筛选注释为IDI的基因,设计特异性引物克隆其编码区,利用相关软件对其进行生物信息学分析,利用实时荧光定量PCR分析其在黄草乌不同器官中的表达情况,在大肠杆菌中表达其重组蛋白,利用功能显色验证其功能.结果 从黄草乌中克隆得到1个IDI基因(AvIDI,Genbank登录号MZ814967).生物信息学分析表明,AvIDI的开放阅读框(open reading frame,ORF)为897 bp,编码298个氨基酸,分子式为C1516H2362N414O452S11,相对分子质量为33 970,理论等电点为5.94,具有异戊烯基焦磷酸异构酶TNTCCSHPL和WGEHELDY2个保守序列.系统进化分析显示,AvIDI与黄龙胆Gentiana lutea IDI的亲缘关系最近.表达分析表明,AvIDI基因在黄草乌根、茎、叶和花中均有表达,在茎中表达量最高.在大肠杆菌中成功表达了 AvIDI重组蛋白,功能显色实验表明,AvIDI编码有功能的IDI蛋白,能促进大肠杆菌中番茄红素的积累.结论 克隆得到AvIDI基因,并通过功能显色实验证明其编码有功能的IDI蛋白,该研究为利用IDI基因调控黄草乌中二萜生物碱生物合成奠定了基础.
文献关键词：
黄草乌;异戊烯基焦磷酸酶;基因克隆;生物信息学分析;功能显色
中图分类号：
作者姓名：
马晓惠;曹小青;管丽娜;李国栋;王一博
作者机构：
云南中医药大学中药学院云南省南药可持续利用研究重点实验室,云南昆明 650500
文献出处：
引用格式：
[1]马晓惠;曹小青;管丽娜;李国栋;王一博-.黄草乌异戊烯基焦磷酸异构酶基因的克隆与功能研究)[J].中草药,2022(16):5142-5148
A类：
异戊烯基焦磷酸异构酶,vilmorinianum,功能显色,AvIDI,MZ814967,C1516H2362N414O452S11,TNTCCSHPL,WGEHELDY2,异戊烯基焦磷酸酶
B类：
黄草乌,酶基因,功能研究,Aconitum,isopentenyl,diphosphate,isomerase,中二,二萜生物碱,生物合成途径,转录组数据,数据筛选,选注,特异性引物,编码区,相关软件,生物信息学分析,不同器官,大肠杆菌,重组蛋白,Genbank,登录号,开放阅读框,reading,frame,ORF,bp,分子式,相对分子质量,等电点,保守序列,系统进化分析,黄龙,龙胆,Gentiana,lutea,亲缘关系,表达分析,有功,番茄红素,基因调控,基因克隆
AB值：
0.214666
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
