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典型文献
百两金萜类代谢相关MYB转录因子挖掘及分析
文献摘要:
为探究百两金MYB转录因子参与萜类代谢生物途径,文中结合Mega 7.0、ORF、The MEME等软件,利用STRING、plantTFDB、KEGG、Mega 7.0、ORF、The MEME Suite等工具分析百两金MYB转录因子家族蛋白理化性质、系统进化、GO注释、蛋白功能等.结果获得了54条序列,MYB转录因子基因Cluster-20697.17470、Cluster-10301.0、Cluster-20709.0编码蛋白具有抑制肉桂酸4-羟化酶(C4 H)的早期合成的作用,间接影响百两金的萜类产物代谢;推测Cluster-10535.0编码蛋白具有响应茉莉酸酯信号的作用.本研究在MYB转录因子家族中获得了参与萜类代谢途径基因Cluster-20709.0、Cluster-20697.17470、Cluster-10301.0和Cluster-10535.0,说明百两金转录因子参与了调节植物的生长以及次级代谢.研究参与萜类代谢生物途径的百两金MYB转录因子,为后续百两金MYB家族基因的挖掘和功能鉴定提供科学依据.
文献关键词:
百两金;MYB转录因子;生物信息学;萜类代谢
作者姓名:
李晓敏;赵春艳;孙静贤;杨青松;高路;熊勇
作者机构:
云南民族大学 民族医药学院,云南 昆明650500;中华全国供销合作总社 昆明食用菌研究所,云南 昆明650221
引用格式:
[1]李晓敏;赵春艳;孙静贤;杨青松;高路;熊勇-.百两金萜类代谢相关MYB转录因子挖掘及分析)[J].云南民族大学学报(自然科学版),2022(06):659-668
A类:
plantTFDB
B类:
百两金,萜类代谢,MYB,生物途径,Mega,ORF,MEME,STRING,Suite,系统进化,蛋白功能,Cluster,编码蛋白,肉桂酸,羟化酶,C4,间接影响,茉莉酸,代谢途径,次级代谢,家族基因,功能鉴定
AB值:
0.192678
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