典型文献
响应ABA胁迫的甘草bZIP转录因子的系统筛选与分析
文献摘要：
甘草为我国最常用的大宗药材之一,主要分布在干旱、半干旱区域,有着重要的经济和生态价值.bZIP转录因子在植物生物或非生物胁迫响应、生长发育、次生代谢产物合成等方面具有重要的调控作用.本研究利用Illumina高通量测序技术对不同浓度脱落酸(ABA)处理的甘草转录组进行测序,并基于己发表的甘草全基因组数据,以拟南芥基因组中发现的bZIP序列为参照,鉴定了甘草中的bZIP转录因子.之后筛选ABA依赖bZIP转录因子基因作为候选基因,对其编码蛋白理化性质、结构以及外源ABA胁迫下基因的表达模式进行分析.共鉴定到69个甘草bZIP转录因子家族基因,命名为GubZIPl-69,并根据它们与拟南芥bZIP的同源相似性分为A～I以及S这10个亚家族.通过计算69个GubZIPs基因在不同外源ABA胁迫下的相对表达量,筛选出可能参与ABA信号通路的调控基因,即 GubZIP 1、GubZIP5、GubZIP8、GubZIP30、GubZIP33和 GubZIP56.外源 ABA胁迫下候选 GubZIPs基因的表达模式分析结果显示,与0mg·L-1浓度ABA处理下相比,25 mg·L-1的ABA没有引起基因的表达模式发生变化,而在50 mg·L-1浓度ABA处理下的表达模式发生了明显的变化,说明这些基因的表达响应50 mg·L-1浓度的ABA,即基因相对表达量均在处理后3 h下降,6 h之后逐渐上升,除了 GubZIP8,12 h后基因相对表达量较0 h均显著上升.本研究为进一步开展甘草bZIP转录因子功能研究,阐明其调控机制奠定了基础,为今后利用分子育种方法培育优质甘草品种提供了科学依据.
文献关键词：
甘草;bZIP转录因子;ABA胁迫;结构分析;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
武立伟;徐志超;王清;聂丽萍;崔英贤;王瑀;宋经元;姚辉
作者机构：
中国医学科学院、北京协和医学院药用植物研究所,濒危药材繁育国家工程实验室,北京100193
文献出处：
引用格式：
[1]武立伟;徐志超;王清;聂丽萍;崔英贤;王瑀;宋经元;姚辉-.响应ABA胁迫的甘草bZIP转录因子的系统筛选与分析)[J].药学学报,2022(03):818-830
A类：
GubZIPl,GubZIPs,GubZIP,GubZIP5,GubZIP8,GubZIP30,GubZIP33,GubZIP56
B类：
ABA,甘草,大宗,半干旱区,生态价值,或非,非生物胁迫,胁迫响应,次生代谢产物,产物合成,研究利用,Illumina,高通量测序技术,脱落酸,转录组,全基因组,基因组数据,拟南芥,候选基因,编码蛋白,家族基因,亚家族,调控基因,表达模式分析,0mg,基因相对表达量,功能研究,调控机制,分子育种,育种方法,表达分析
AB值：
0.196677
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