典型文献
红花光调控信号途径关键基因CtHY5的克隆及表达分析
文献摘要：
目的 以药用植物红花Carthamus tinctorius为研究对象,克隆光信号途径关键转录因子HY5基因,并对其进行生物信息学和表达模式分析,为红花HY5基因的功能研究提供参考.方法 以红花转录数据为参考,设计引物,采用PCR扩增方法从红花中克隆得到HY5的全长cDNA和DNA序列.运用生物信息学方法对该基因进行分析,预测编码蛋白的结构与功能,并通过荧光定量PCR方法检测CtHY5基因在红花不同组织及花发育不同时期的表达情况.结果 CtHY5基因的cDNA全长为462 bp,编码153个氨基酸,DNA全长为1941 bp,包含4个外显子和3个内含子.生物信息学分析表明,CtHY5为亲水性蛋白,定位于细胞核中.系统进化树及模体结构分析结果表明CtHY5与来自菊科的刺菜蓟、黄花蒿、薇甘菊、向日葵、莴苣中的HY5进化关系较近.定量分析表明,在白色红花和红色红花中,CtHY5基因均在花中表达量最高,其次为茎和苞片,在根中表达量最低.此外,除了根外,CtHY5基因在白色红花各组织中的表达量要明显高于红色红花.结论 首次从红花中克隆得到了光信号途径关键转录因子CtHY5基因,并研究了该基因在不同花色红花品系中的表达模式,为进一步研究其生物学功能奠定了基础.
文献关键词：
红花;光信号途径;HY5;基因克隆;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
谭政委;鲁丹丹;李磊;余永亮;许兰杰;杨红旗;杨青;董薇;李春明;安素妨;芦海灵;梁慧珍
作者机构：
河南省农业科学院芝麻研究中心,河南郑州 450002
文献出处：
引用格式：
[1]谭政委;鲁丹丹;李磊;余永亮;许兰杰;杨红旗;杨青;董薇;李春明;安素妨;芦海灵;梁慧珍-.红花光调控信号途径关键基因CtHY5的克隆及表达分析)[J].中草药,2022(18):5825-5833
A类：
CtHY5,刺菜蓟
B类：
红花,花光,光调控,关键基因,表达分析,药用植物,Carthamus,tinctorius,光信号途径,关键转录因子,表达模式分析,功能研究,引物,增方,全长,cDNA,生物信息学方法,预测编码,编码蛋白,结构与功能,不同组织,花发育,bp,外显子,内含子,生物信息学分析,亲水性,细胞核,系统进化树,模体,菊科,黄花蒿,薇甘菊,向日葵,莴苣,进化关系,苞片,同花,花色,品系,生物学功能,基因克隆
AB值：
0.316793
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