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吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析
文献摘要：
Dof(DNA binding with one finger)转录因子是植物中特有的一类转录因子,在植物种子发育、组织分化和代谢调控方面起着非常重要的调控作用.为了研究Dof基因家族在人参中的数量和功能,该文以人参转录组数据库为基础,利用生物信息学手段,对人参Dof基因家族成员进行鉴定及其结构、进化、功能分化、表达模式及互作关系等进行了系统分析;同时,将人参Dof基因与已知人参皂苷合成关键酶基因进行关联分析,最终筛选到参与调控人参皂苷生物合成的候选PgDof基因.结果 表明,吉林人参Dof基因家族含有57条基因;PgDof基因均具有Zf-Dof保守基序,在进化上比较保守且分成5个组群;表达模式分析结果确定了PgDof基因家族成员在不同组织部位、不同年生和不同农家品种之间存在不同程度的表达差异,同时通过"基因-皂苷含量""基因-基因"连锁分析,获得了PgDof14-1基因是参与调控人参皂苷生物合成的重要候选基因,并建立了该基因的人参发状根遗传转化体系,获得了阳性发状根无性系.该研究为人参中Dof基因家族的研究奠定了理论基础.
文献关键词：
人参;Dof基因家族;功能基因;基因表达
中图分类号：
作者姓名：
王康宇;郭彦秀;马翀;赵明珠;李凤华;张美萍;王义
作者机构：
吉林农业大学生命科学学院,吉林长春130118;吉林省人参基因资源开发与利用工程研究中心,吉林长春130118;黑龙江广播电视大学教学部,黑龙江哈尔滨150080
文献出处：
引用格式：
[1]王康宇;郭彦秀;马翀;赵明珠;李凤华;张美萍;王义-.吉林人参Dof基因家族的鉴定及表达模式分析)[J].中国中药杂志,2022(01):62-71
A类：
PgDof,Zf,PgDof14
B类：
基因家族,表达模式分析,binding,one,finger,植物种子,种子发育,组织分化,代谢调控,转录组数据,利用生物,互作关系,知人,人参皂苷,合成关键酶,关键酶基因,生物合成,保守基序,组群,不同组织,组织部位,农家品种,表达差异,皂苷含量,连锁分析,重要候选基因,发状根,遗传转化体系,无性系,功能基因
AB值：
0.26406
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