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红花NAC基因家族鉴定及干旱胁迫响应分析
文献摘要：
NAC(NAM/ATAF/CUC)转录因子是植物最大的转录基因家族之一,在植物应对干旱胁迫中具有重要作用.为了研究NAC基因家族在红花中的数量及功能,该文以红花的全基因组数据为基础,利用生物信息学手段对红花NAC基因家族成员进行鉴定,并分析了其理化性质、染色体定位、系统进化、基因结构、保守结构域及保守基序.同时,利用qRT-PCR方法分析了 4个NAC基因在干旱胁迫处理不同时间后的转录水平.结果表明,红花NAC基因家族有87个成员,不均匀分布在11条染色体上,其中第12号染色体不存在NAC基因;87个NAC基因氨基酸数目为103～974个,CDS数目为3～9个;进化分析可将其分为17个亚家族;保守结构域分析大多数基因含有5个保守的亚结构域A～E;保守基序分析发现,motif2在NAC基因中最保守.表达模式分析发现干旱胁迫不同处理时间后,4个与抗旱相关的NAC基因在叶片中的转录水平均呈上调趋势,推测这4个NAC基因可能与红花抗旱性有关.该研究为红花NAC转录因子进一步功能研究奠定了理论基础,为培育耐旱性红花品种提供参考依据.
文献关键词：
红花;NAC基因家族;干旱胁迫;转录水平
中图分类号：
作者姓名：
詹鹏;钟祖昌;向妮艳;覃瑞;江雄波;刘虹
作者机构：
中南民族大学生命科学学院生物技术国家民委重点实验室武陵山区特色资源植物种质保护与利用湖北省重点实验室,湖北武汉430074;湖北生态职业技术学院,湖北武汉430200
文献出处：
引用格式：
[1]詹鹏;钟祖昌;向妮艳;覃瑞;江雄波;刘虹-.红花NAC基因家族鉴定及干旱胁迫响应分析)[J].中国中药杂志,2022(20):5520-5529
A类：
B类：
红花,NAC,基因家族鉴定,干旱胁迫响应,响应分析,NAM,ATAF,CUC,全基因组,基因组数据,利用生物,染色体定位,系统进化,基因结构,保守结构域,保守基序,qRT,胁迫处理,转录水平,不均匀分布,CDS,进化分析,亚家族,亚结构,motif2,表达模式分析,不同处理,处理时间,旱相,抗旱性,功能研究,耐旱性
AB值：
0.289281
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