典型文献
鸦胆子转录组测序及基因功能注释
文献摘要：
目的 丰富临床常用中药鸦胆子的基因资源,揭示其主要活性成分苦木素类化合物的生物合成途径.方法 采用高通量测序技术对鸦胆子进行转录组测序分析,构建鸦胆子转录组数据库,经de novo组装后进行生物信息学分析.结果 本研究共获得85 828条Unigenes,平均长度为1775 bp;有68 806条Unigenes在七大功能数据库得到注释,分别有67 087(78.16％)、59 850(69.73％)、49 801(58.02％)、53 755(62.63％)、52 416(61.07％)、43 042(50.15％)以及 52 214(60.84％)条 Unigenes 分别 注释到 NR、NT、SwissProt、KOG、KEGG、GO 和 Pfam数据库.KEGG分析发现276条萜类骨架(苦木素合成的重要前体)生物合成途径.球蛋白水解物具有显著的抗肿瘤活性,本研究共获得56 624个编码蛋白框(CDS)序列,其中有10个与球蛋白相关.共检测到36 045个简单重复序列(SSR),且以单核苷酸重复基序出现频率最高,其次是二核苷酸与三核苷酸重复基序.结论 本研究首次对鸦胆子转录组进行全面的测序分析,可进一步促进鸦胆子药用价值的开发.
文献关键词：
鸦胆子;转录组分析;代谢通路;球蛋白;苦木素
中图分类号：
作者姓名：
石好宇;王慧芸;赵艺;朱甫臻;尹艳燕;缪剑华;王灵芝
作者机构：
北京中医药大学生命科学学院,北京 100029;广西药用植物园,广西药用植物资源保护与遗传改良重点实验室,南宁 530023
文献出处：
引用格式：
[1]石好宇;王慧芸;赵艺;朱甫臻;尹艳燕;缪剑华;王灵芝-.鸦胆子转录组测序及基因功能注释)[J].中南药学,2022(06):1267-1273
A类：
苦木素
B类：
鸦胆子,基因功能注释,富临,基因资源,主要活性成分,类化合物,生物合成途径,高通量测序技术,转录组测序分析,转录组数据,de,novo,生物信息学分析,共获,Unigenes,平均长度,bp,NR,NT,SwissProt,KOG,Pfam,萜类,蛋白水解,水解物,抗肿瘤活性,编码蛋白,CDS,白相,简单重复序列,SSR,单核苷酸,基序,药用价值,转录组分析,代谢通路
AB值：
0.297361
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