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火麻仁基原植物bZIP基因家族鉴定及其调控油脂代谢的功能初探
文献摘要：
bZIP(basic leucine zipper)基因家族是真核生物中最大的转录因子家族之一,其成员在逆境响应、次级代谢、植物生长、种子发育等方面发挥着重要作用.为探究火麻仁基原植物大麻(Cannabis sativa L.)bZIP(CsbZIP)基因的生物学功能,本研究基于大麻全基因组和转录组数据,利用生物信息学方法对CsbZIP基因家族进行系统性研究.结果表明,在大麻中鉴定到55个CsbZIP基因家族成员(CsbZIP1～CsbZIP55),分布在10条染色体上,属于12个亚家族,同一亚家族成员之间的基因结构和蛋白基序分布相似.片段重复是CsbZIP基因家族扩张的主要因素.顺式作用元件分析表明73个油脂合成基因的启动子区含有G-box或A-box元件,qRT-PCR实验表明7个CsbZIP基因和7个油脂合成基因在火麻仁中的相对表达量较高.相关性分析表明7个CsbZIP基因和7个油脂合成基因之间存在显著的正相关关系.本研究揭示了 CsbZIP基因的结构特征、进化方式和表达模式,为进一步研究CsbZIP基因对火麻仁油脂代谢的调控提供了重要线索.
文献关键词：
火麻仁;药用大麻;bZIP基因家族;油脂代谢;表达模式
中图分类号：
作者姓名：
怀浩;宁康;侯聪;杨树明;汪鋆植;陈士林;董林林
作者机构：
三峡大学生物与制药学院,湖北宜昌443002;中国中医科学院中药研究所,北京100700;云南大麻产业投资有限公司,云南昆明650217
文献出处：
引用格式：
[1]怀浩;宁康;侯聪;杨树明;汪鋆植;陈士林;董林林-.火麻仁基原植物bZIP基因家族鉴定及其调控油脂代谢的功能初探)[J].药学学报,2022(08):2528-2542
A类：
CsbZIP,CsbZIP1,CsbZIP55
B类：
基原,基因家族鉴定,控油,油脂代谢,basic,leucine,zipper,真核生物,逆境响应,次级代谢,植物生长,种子发育,Cannabis,sativa,生物学功能,全基因组,转录组数据,利用生物,生物信息学方法,系统性研究,亚家族,基因结构,基序,顺式作用元件,油脂合成,启动子区,box,qRT,相对表达量,表达模式,火麻仁油,药用大麻
AB值：
0.238205
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