典型文献
牦牛GSTK1基因序列特征分析及其组织表达谱构建
文献摘要：
旨在探讨谷胱甘肽硫转移酶K1(Glutathione S-Transferase Kappa1,GSTK1)基因序列特征.以牦牛为试验对象,通过RT-PCR技术扩增GSTK1基因序列并分析生物信息学,采用RT-qPCR技术构建其在牦牛不同组织中的表达谱.ORF分析显示,牦牛GSTK1基因编码区为618 bp,编码氨基酸为205个.系统发育树分析显示,牦牛与野牦牛(99.68％)、黄牛(99.68％)和野牛(99.40％)之间的同源性最高,与北极熊(87.63％)、野猪(87.25％)和马(87.01％)之间的同源性最低.蛋白预测分析显示,GSTK1蛋白为不稳定的亲水蛋白,存在12个磷酸化位点.高级结构预测分析显示,GSTK1蛋白的主要成分为α-螺旋(50.73％)、无规卷曲(40.00％)和延伸链(9.27％).组织表达分析发现GSTK1在所检测牦牛卵巢、小肠、脾、肝、肾、肌肉、肺和心组织中均有表达,其中表达量最高的组织是肝,表达量最低的组织是脾和心,且与其他组织差异显著(P<0.05).本研究获得了牦牛GSTK1基因的序列特征及组织表达谱,为进一步挖掘牦牛GSTK1基因的功能提供参考依据.
文献关键词：
牦牛;GSTK1基因;序列特征;生物信息学;组织表达谱
中图分类号：
作者姓名：
潘帮婷;熊显荣;于海玲;杨满珍;胡宇磊;朱艳锦;费熙熙;李键
作者机构：
西南民族大学畜牧兽医学院,四川 成都610041;青藏高原动物遗传资源保护与利用教育部重点实验室,四川 成都610041;动物科学国家民委重点实验室,四川 成都610041
文献出处：
引用格式：
[1]潘帮婷;熊显荣;于海玲;杨满珍;胡宇磊;朱艳锦;费熙熙;李键-.牦牛GSTK1基因序列特征分析及其组织表达谱构建)[J].西南民族大学学报（自然科学版）,2022(06):598-605
A类：
GSTK1,Transferase,Kappa1
B类：
基因序列特征,序列特征分析,组织表达谱,谷胱甘肽硫转移酶,Glutathione,qPCR,技术构建,不同组织,ORF,基因编码,编码区,bp,系统发育树分析,野牦牛,黄牛,野牛,同源性,北极熊,野猪,预测分析,亲水,磷酸化,结构预测,无规,卷曲,组织表达分析,小肠,他组织,组织差异
AB值：
0.259732
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