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珊瑚菜抗盐相关基因GlERF11克隆与盐胁迫表达分析
文献摘要：
目的 鉴定珊瑚菜抗盐基因GlERF11并分析其在盐处理下的表达量变化.方法 对GlERF11基因进行cDNA全长克隆以及生物信息学分析,使用荧光定量PCR方法对GlERF11基因进行定量表达分析.结果 GlERF11基因cDNA全长1019 bp,开放阅读框全长537 bp,编码178个氨基酸.生物信息学分析显示,GlERF11蛋白为亲水性蛋白,无跨膜结构域,相对分子质量为19710.95 Da,包含AP2超家族保守结构域.系统进化树分析显示,GlERF11蛋白与伞形科植物胡萝卜ERF11蛋白亲缘关系较近.荧光定量分析显示,珊瑚菜幼苗的GlERF11基因受盐胁迫影响后表达量均有所提高,处理后12 h变化最为显著.结论 本研究针对珊瑚菜抗盐相关基因GlERF11开展生物信息学分析,研究为珊瑚菜品种改良以及育种提供了重要的理论基础与思路.
文献关键词：
珊瑚菜;抗盐基因;生物信息学;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
徐瑶;任宏伟;孙唯航;张馨方;田雪梅;谭玲玲;袁涛;高婷
作者机构：
青岛农业大学生命科学学院/山东省高校植物生物技术重点实验室 青岛 266109;青岛农业大学建筑工程学院 青岛 266109
文献出处：
引用格式：
[1]徐瑶;任宏伟;孙唯航;张馨方;田雪梅;谭玲玲;袁涛;高婷-.珊瑚菜抗盐相关基因GlERF11克隆与盐胁迫表达分析)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1875-1884
A类：
GlERF11,抗盐基因,ERF11
B类：
珊瑚菜,盐胁迫表达,表达分析,盐处理,cDNA,全长,生物信息学分析,定量表达,bp,开放阅读框,亲水性,跨膜结构域,相对分子质量,Da,AP2,超家族,保守结构域,系统进化树分析,伞形科,胡萝卜,亲缘关系,幼苗,菜品,品种改良,育种
AB值：
0.223261
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