典型文献
乌拉尔甘草TIFY基因家族鉴定及调控分析
文献摘要：
目的 为了探索乌拉尔甘草(Glycyrrhiza uralensis Fisch.)TIFY基因家族的特征并预测其功能,本研究在全基因组层面,应用生物信息学方法对乌拉尔甘草TIFY基因家族进行鉴定和分析.方法 在乌拉尔甘草全基因组数据基础上,利用NCBI、MEME及TBtools等工具,结合基因保守结构域,对乌拉尔甘草TIFY基因家族的序列特征、分类、系统发育和基因表达模式进行分析.结果 在乌拉尔甘草中鉴定到TIFY家族基因成员18个(GurTIFY1-GurTIFY18),分别属于TIFY、JAZ、PPD、ZML四个亚家族,编码的核苷酸长度为444-1266 bp,氨基酸长度在147-421 aa之间,等电点为4.57-9.68,分子质量为16741.11-44426.5 Da,含有10个保守基序和4个保守结构域.基因表达结果表明GurTIFY基因中GurTIFY15、GurTIFY4、GurTIFY1、GurTIFY11等在乌拉尔甘草叶和根中的表达水平具有显著差异性.结论 本研究为深入理解TIFY基因响应非生物胁迫的调控机制和参与次生代谢物质累积的功能奠定基础,并为乌拉尔甘草优质品种选育提供科学参考.
文献关键词：
生物信息学;乌拉尔甘草;TIFY基因家族;鉴定;功能分析
中图分类号：
作者姓名：
秦振芬;孟祥霄;温东;朱雪雯;王艳;Botir Khaitov;Atia tul Wahab;孙伟
作者机构：
中国中医科学院中药研究所/中药鉴定与安全性评估北京市重点实验室 北京 100700;中国医学科学院北京协和医学院药用植物研究所 北京 100193;卡拉奇大学国际化学与生命科学研究院化学研究所 卡拉奇 75270;国际生物盐农业中心 塔什干 100084;卡拉奇大学国际化学与生命科学研究院分子医学与药物研究所 卡拉奇 75270
文献出处：
引用格式：
[1]秦振芬;孟祥霄;温东;朱雪雯;王艳;Botir Khaitov;Atia tul Wahab;孙伟-.乌拉尔甘草TIFY基因家族鉴定及调控分析)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1855-1864
A类：
GurTIFY1,GurTIFY18,GurTIFY,GurTIFY15,GurTIFY4,GurTIFY11
B类：
乌拉尔甘草,基因家族鉴定,Glycyrrhiza,uralensis,Fisch,全基因组,生物信息学方法,基因组数据,数据基础,NCBI,MEME,TBtools,保守结构域,序列特征,系统发育,基因表达模式,家族基因,JAZ,PPD,ZML,亚家族,bp,aa,等电点,分子质量,Da,保守基序,草叶,叶和根,非生物胁迫,调控机制,次生代谢物质,优质品种,品种选育,功能分析
AB值：
0.244041
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