典型文献
黄连NRAMP5基因的克隆与生物信息学分析
文献摘要：
目的 获得并分析黄连(Coptis chinensis Franch.)中自然抗性相关巨噬细胞蛋白(Natural Resistance-Associated Macrophage Protein,NRAMP)的编码基因.方法 根据黄连基因组测序结果中的NRAMP基因序列设计特异性引物,经PCR扩增得到黄连NRAMP5编码序列,进行TA克隆、测序及生物信息学分析.结果 得到黄连NRAMP5 cDNA序列,全长1611bp,编码536个氨基酸,通过与Genbank上的其他蛋白序列比对,将其命名为CcNRAMP5;序列分析表明黄连NRAMP5基因编码的氨基酸序列包含一个典型的NRAMP结构域(PF01566),是一种拥有11个跨膜结构域,亚细胞定位于质膜处的膜蛋白,具有疏水性强的特点.二级结构中肽链构象主要包括α-螺旋与无规则卷曲两部分;三级结构模型具有葡萄球菌锰转运突变体(MntH)的晶体结构.通过系统进化关系分析推测其可能具有二价金属离子转运功能.结论 首次通过克隆得到黄连NRAMP5基因,并运用生物信息学方法对其理化性质、结构特征等进行了分析预测,这些结果将为黄连NRAMP5基因的功能研究以及其对镉转运的调控机制提供理论依据.
文献关键词：
黄连;NRAMP5;基因克隆;生物信息学分析
中图分类号：
作者姓名：
王文斌;朱海兰;莫静;刘迪;胡志刚;汪波
作者机构：
湖北中医药大学药学院 武汉 430065;湖北省药品监督检验研究院 武汉 430075;湖北大学生命科学学院 武汉 430062
文献出处：
引用格式：
[1]王文斌;朱海兰;莫静;刘迪;胡志刚;汪波-.黄连NRAMP5基因的克隆与生物信息学分析)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1962-1969
A类：
NRAMP5,1611bp,CcNRAMP5,PF01566,MntH
B类：
黄连,生物信息学分析,Coptis,chinensis,Franch,巨噬细胞,Natural,Resistance,Associated,Macrophage,Protein,编码基因,基因组测序,基因序列,序列设计,特异性引物,编码序列,TA,cDNA,全长,Genbank,序列比对,序列分析,基因编码,氨基酸序列,跨膜结构域,亚细胞定位,质膜,膜蛋白,疏水性,二级结构,肽链,构象,无规则,卷曲,三级结构,突变体,晶体结构,系统进化,进化关系,关系分析,二价,价金,金属离子,离子转运,运功,生物信息学方法,分析预测,功能研究,镉转运,调控机制,基因克隆
AB值：
0.390833
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