典型文献
丹参SmCOP1与调控丹参酮和丹酚酸合成相关转录因子互作筛选
文献摘要：
目的 预测分析并克隆丹参E3泛素连接酶SmCOP1(constitutively photomorphogenic1),并对其靶基因进行初筛,为丹参次生代谢关键调控因子MYB以及bHLH等转录因子泛素化研究做准备.方法 本研究利用拟南芥AtCOP1蛋白序列,用HMMER3程序和在线程序SMART,在丹参全基因组数据库筛选到丹参中的E3泛素连接酶SmCOP1序列,经RT-PCR技术获得丹参cDNA,以其为模板设计引物扩增,并利用生物信息学方法对该基因及其编码蛋白进行相关分析.通过酵母双杂实验对其调控丹参酮和酚酸物质机制进行初步研究.结果 结果表明SmCOP1的2个蛋白均为不稳定亲水性蛋白,其N-端为环形锌指结构域(RING–finger),C-端为WD40重复结构域.通过建立进化树表明SmCOP1b和AtCOP1是直系同源的关系,而SmCOP1a和SmCOP1b是旁系同源的关系.Y2H实验显示SmCOP1a与SmPAP1互作.结论 成功克隆并预测分析丹参E3泛素连接酶SmCOP1,并初步发现其可能通过靶向MYB转录因子SmPAP1对其泛素化修饰参与调控酚酸类物质的代谢.
文献关键词：
丹参;SmCOP1;克隆;靶向修饰
中图分类号：
作者姓名：
邓淮钰;李倩;郭园艺;张骥骜;郭宏波;麻鹏达
作者机构：
西北农林科技大学化学与药学院 咸阳 712100;西北农林科技大学生命科学院 咸阳 712100
文献出处：
引用格式：
[1]邓淮钰;李倩;郭园艺;张骥骜;郭宏波;麻鹏达-.丹参SmCOP1与调控丹参酮和丹酚酸合成相关转录因子互作筛选)[J].世界科学技术-中医药现代化,2022(05):1838-1854
A类：
SmCOP1,photomorphogenic1,AtCOP1,HMMER3,SmCOP1b,SmCOP1a,SmPAP1
B类：
丹参酮,丹酚酸,预测分析,E3,泛素连接酶,constitutively,靶基因,初筛,次生代谢,调控因子,MYB,bHLH,做准,研究利用,拟南芥,在线程序,SMART,全基因组,基因组数据,技术获得,cDNA,模板设计,引物,利用生物,生物信息学方法,编码蛋白,酵母双杂,酚酸物质,定亲,亲水性,锌指,结构域,RING,finger,WD40,进化树,直系,旁系,Y2H,泛素化修饰,酚酸类物质,靶向修饰
AB值：
0.335521
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