典型文献
21个物种生长激素基因完整编码区比较基因组学分析
文献摘要：
为探究不同物种生长激素(GH)基因的遗传变异及多样性,本研究基于比较基因组学方法对NCBI数据库中马鹿、绵羊、山羊、牛、家马、猪、人、狨、猕猴、家犬、家猫、水貂、小家鼠、褐家鼠、原鸡、火鸡、鹌鹑、野鸭、鹅、草鱼和斑马鱼共计21个物种的GH基因完整编码区序列进行了系统的生物信息学分析,进一步对不同物种该基因编码氨基酸序列的理化特性、亲水性、信号肽裂解位点及二级结构进行了预测,构建了马鹿GH蛋白三维结构模型.结果表明,21个物种150条GH基因序列中检测到426个多态位点,共生成92种单倍型;GH基因在物种间的遗传多样性比较丰富,种内相对保守;绵羊与山羊亲缘关系最近,草鱼与其他物种亲缘关系最远;除马鹿、绵羊、山羊、牛、火鸡和鹌鹑外,其他物种GH蛋白理论等电点大多低于7.00,属不稳定酸性蛋白,均存在1个信号肽且亲缘关系较近的物种具有相似的裂解位点;马鹿GH基因编码氨基酸序列的二级结构元件以α-螺旋和无规则卷曲为主,GH蛋白三级结构存在4个反向平行的互补螺旋.该研究结果可为进一步分析和研究GH基因功能及其应用奠定基础.
文献关键词：
生长激素基因;遗传多样性;马鹿;比较基因组学;物种
中图分类号：
作者姓名：
宋兴超;孟金柱;赵园园;吴震洋;安清明
作者机构：
铜仁学院农林工程与规划学院贵州省梵净山地区生物多样性保护与利用重点实验室,贵州 铜仁 554300
文献出处：
引用格式：
[1]宋兴超;孟金柱;赵园园;吴震洋;安清明-.21个物种生长激素基因完整编码区比较基因组学分析)[J].特产研究,2022(05):107-114
A类：
生长激素基因
B类：
整编,编码区,比较基因组学分析,GH,遗传变异,NCBI,中马,马鹿,猕猴,家犬,家猫,水貂,小家鼠,褐家鼠,火鸡,鹌鹑,野鸭,草鱼,斑马鱼,生物信息学分析,基因编码,氨基酸序列,理化特性,亲水性,信号肽,二级结构,三维结构模型,基因序列,多态位点,单倍型,种间,遗传多样性,比较丰富,种内,绵羊与山羊,亲缘关系,最远,等电点,结构元,无规则,卷曲,三级结构,分析和研究,基因功能
AB值：
0.334631
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