典型文献
西洋参根腐病抗性相关基因PqDELLA1的克隆及表达分析
文献摘要：
目的:克隆西洋参PqDELLA1基因,进行生物信息学分析,并探讨其在西洋参抗根腐病中的表达模式.方法:根据已获得的西洋参转录组数据,设计PqDELLA1基因全长扩增引物,利用无缝克隆的方法获得全长互补脱氧核糖核酸(cDNA);采用国家生物技术信息中心(National Center for Biotechnology Information,NCBI)在线Blastp、DNAMAN和MEGA 6.0等软件对序列进行生物信息学分析;通过实时荧光定量多聚核苷酸链式反应(real-time quantitative polymerase chain reaction,qPCR)检测PqDELLA1基因的组织表达及诱导表达模式.结果:扩增得到西洋参PqDELLA1基因,其cDNA序列为1743 bp,编码580个氨基酸;PqDELLA1蛋白相对分子质量为63910,理论等电点为5.01,不含信号肽,为非跨膜蛋白,定位于细胞核,与番茄SlDELLA蛋白氨基酸相似度最高.qPCR结果显示PqDELLA1基因在叶中表达量最高,其次为茎,根中最少;该基因的表达受根腐病病原菌茄病镰刀菌(Fusarium solani)的诱导,接种后5 d内持续升高后降低.结论:首次克隆出西洋参PqDELLA1基因并进行了生物信息学和表达特性分析,发现该基因可响应F.solani的侵染,为后续解析其参与西洋参抗病反应的分子机制提供参考.
文献关键词：
西洋参;根腐病;PqDELLA1;生物信息学;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
杨姗姗;王仪;刘紫祺;邵慧慧;高微微
作者机构：
中国医学科学院 北京协和医学院 药用植物研究所,北京 100193
文献出处：
引用格式：
[1]杨姗姗;王仪;刘紫祺;邵慧慧;高微微-.西洋参根腐病抗性相关基因PqDELLA1的克隆及表达分析)[J].中国现代中药,2022(05):776-783
A类：
PqDELLA1,SlDELLA
B类：
西洋参,根腐病抗性,抗性相关基因,表达分析,生物信息学分析,转录组数据,全长,扩增引物,无缝克隆,脱氧核糖核酸,cDNA,生物技术,信息中心,National,Center,Biotechnology,Information,NCBI,Blastp,DNAMAN,MEGA,实时荧光定量多聚核苷酸链式反应,real,quantitative,polymerase,chain,reaction,qPCR,组织表达,诱导表达模式,bp,白相,相对分子质量,等电点,信号肽,跨膜蛋白,细胞核,番茄,根腐病病原菌,茄病镰刀菌,Fusarium,solani,表达特性,侵染,抗病反应
AB值：
0.305285
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