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三七细胞色素P450酶基因PnCyp450_3响应丛枝菌根真菌诱导的表达特性分析
文献摘要：
目的 基于三七根转录组数据库,克隆三七皂苷合成关键酶细胞色素P450(cytochrome P450,CYP450)基因,对其进行生物信息学分析,明确其对丛枝菌根真菌(arbuscular mycorrhizal fungi,AMF)诱导的响应,为进一步研究其催化特性奠定基础.方法 基因PnCyp450_3开放阅读框(open reading frame,ORF)克隆及克隆载体构建依据相应试剂盒说明书,通过化学转化法及氨苄青霉素抗性标记筛选阳性克隆.利用各种在线工具或软件完成生物信息学分析及系统发育树构建;基因表达特性分析采用实时荧光定量(real-time fluorescence quantitative,qPCR)技术.结果成功克隆了 1个三七细胞色素P450超家族基因PnCyp450_3,其ORF全长1617 bp,编码538个氨基酸,预测蛋白相对分子质量为59 690,等电点(pI)为8.50,含有5个保守结构域.组织表达特性结果显示,在主根、须根部位,PnCyp450_3均可响应根内球囊霉(Glomus intraradices)的诱导而显著上调表达(P＜0.05),其中主根相对表达量最高(1.85倍),须根次之(1.22倍).结论PnCyp450_3是一个编码538个氨基酸的CYP450超家族基因,在主根、须根中均可响应根内球囊霉的诱导而显著上调表达,为深入研究三七皂苷合成关键酶基因响应生物因子诱导的调控机制提供了数据支持,具有重要的参考价值.
文献关键词：
三七;细胞色素P450;丛枝菌根真菌;生物信息学;实时荧光定量
中图分类号：
作者姓名：
曹冠华;张兴开;柏旭;毕悦;殷红伟;张芸;贺森
作者机构：
云南中医药大学中药学院暨云南省南药可持续利用重点实验室,云南昆明 650500;云南中医药大学昆明市澜湄区域传统药物资源开发利用研发中心,云南昆明 650500;曲靖师范学院生物资源与食品工程学院,云南高原生物资源保护与利用研究中心,云南曲靖 655000
文献出处：
引用格式：
[1]曹冠华;张兴开;柏旭;毕悦;殷红伟;张芸;贺森-.三七细胞色素P450酶基因PnCyp450_3响应丛枝菌根真菌诱导的表达特性分析)[J].中草药,2022(21):6848-6856
A类：
PnCyp450
B类：
细胞色素,丛枝菌根真菌,七根,转录组数据,三七皂苷,合成关键酶,cytochrome,CYP450,生物信息学分析,arbuscular,mycorrhizal,fungi,AMF,开放阅读框,open,reading,frame,ORF,克隆载体,载体构建,构建依据,应试,试剂盒,说明书,化学转化,转化法,氨苄青霉素,抗性标记,标记筛选,系统发育树,基因表达特性,real,fluorescence,quantitative,qPCR,超家族,家族基因,全长,bp,白相,相对分子质量,等电点,pI,保守结构域,组织表达特性,主根,须根,根部,球囊,Glomus,intraradices,相对表达量,关键酶基因,生物因子,调控机制
AB值：
0.361307
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