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陆地棉GELP家族基因鉴定及其响应胁迫的表达分析
文献摘要：
GELP型脂肪酶(GDSL-type esterase/lipase proteins,GELPs)是一类N端含有GDSL-motif的脂质水解酶,在植物生长发育、应激反应及病原菌防御中均发挥非常重要的作用.基于最新发布的陆地棉基因组数据,从全基因组水平上鉴定出210个陆地棉GELP基因,根据系统发育关系将其分为10个亚家族(A～J).这些GhGELP基因不均匀地分布在26条染色体上,且主要分布在染色体两端.基因结构分析表明,高达66.7％的GhGELP基因被4个内含子打断,其编码区域由5个外显子组成.分析发现,GhGELP基因启动子区域共存在7种激素和逆境胁迫响应元件.最后,利用RNA-seq数据研究了GhGELP基因在黄萎病菌和多种非生物胁迫处理下的表达谱.表达分析显示,大多数GhGELP基因响应黄萎病菌诱导后表达量下调,受非生物胁迫诱导后亦呈下调表达趋势,且一些成员可同时响应多种非生物胁迫.对棉花GELP基因家族进行了鉴定和分析,为后续研究其功能提供了一定的理论依据.
文献关键词：
陆地棉;GELP基因家族;基因鉴定;系统发育分析;胁迫响应
中图分类号：
作者姓名：
默韶京;王志城;王省芬;刘正文;吴立强;张桂寅;马峙英;张艳;段会军
作者机构：
河北农业大学农学院,华北作物改良与调控国家重点实验室,河北省作物种质资源重点实验室,河北保定071000
文献出处：
引用格式：
[1]默韶京;王志城;王省芬;刘正文;吴立强;张桂寅;马峙英;张艳;段会军-.陆地棉GELP家族基因鉴定及其响应胁迫的表达分析)[J].中国农业科技导报,2022(02):93-103
A类：
GELP,GELPs,GhGELP
B类：
家族基因,基因鉴定,表达分析,脂肪酶,GDSL,type,esterase,lipase,proteins,motif,脂质水解,水解酶,植物生长发育,应激反应,陆地棉基因组,基因组数据,全基因组,系统发育关系,亚家族,基因结构,内含子,打断,编码区,外显子,子组,基因启动子区,启动子区域,逆境胁迫响应,响应元,seq,数据研究,黄萎病,非生物胁迫处理,表达谱,棉花,基因家族,系统发育分析
AB值：
0.304372
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