典型文献
木薯PEPC基因家族成员鉴定及表达分析
文献摘要：
磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶(PEPC)是C4植物光合作用的关键酶,而木薯是C3-C4型植物,MePEPC在栽培种的表达量显著高于野生型,迄今尚未有人对MePEPC进行过系统研究.为了解木薯中MePEPC家族成员的基本信息,本文运用生物信息学方法在木薯全基因组中确认了5个MePEPC基因家族成员,并对MePEPC基因家族进行基本理化性质分析、亚细胞定位预测、进化树分析、染色体定位、二级结构预测、基因结构域及启动子顺式作用元件预测.结果表明,鉴定到5个MePEPC基因家族成员,分布在5条染色体上,其中分布在3号染色体的MePEPC2发生可变剪切,序列提前终止,发生功能缺失.系统进化树表明,MePEPC可分为2个亚家族(植物型和细菌型),同组成员基因结构和功能域相似.MePEPC家族成员启动子区域含有不同数量的光响应元件、激素响应元件及胁迫响应元件,表明MePEPC基因家族成员可能参与不同的生长发育调节过程.表达谱显示,MePEPC1、MePEPC4和MePEPC5具有较高表达,且在不同光照时间、不同发育时期、干旱及ABA胁迫下呈现出不同的表达模式,而MePEPC2和MePEPC3表达量极低,几乎不表达.以上研究为深入研究MePEPC基因家族在木薯中的功能提供了基础数据,为木薯高光效育种提供候选基因.
文献关键词：
木薯;磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶;表达谱;干旱;ABA;昼夜节律
中图分类号：
作者姓名：
李相辰;沈旭;周新成;陈新;王海燕;王文泉
作者机构：
黑龙江八一农垦大学农学院, 黑龙江大庆 163319;海南大学热带作物学院, 海南海口 570228;中国热带农业科学院热带生物技术研究所 / 农业农村部热带作物生物学与遗传资源利用重点实验室 / 海南热带农业资源研究院 / 海南省热带农业生物资源保护与利用重点实验室, 海南海口 571101
文献出处：
引用格式：
[1]李相辰;沈旭;周新成;陈新;王海燕;王文泉-.木薯PEPC基因家族成员鉴定及表达分析)[J].作物学报,2022(12):3108-3119
A类：
MePEPC,MePEPC2,MePEPC1,MePEPC4,MePEPC5,MePEPC3
B类：
木薯,基因家族,成员鉴定,表达分析,磷酸烯醇式丙酮酸羧化酶,光合作用,关键酶,栽培种,野生型,生物信息学方法,全基因组,基本理化性质,性质分析,亚细胞定位,定位预测,进化树分析,染色体定位,二级结构,结构预测,基因结构,结构域,顺式作用元件,可变剪切,提前终止,系统进化树,亚家族,菌型,组成员,结构和功能,功能域,启动子区域,光响应,响应元,激素响应,胁迫响应,发育调节,表达谱,光照时间,不同发育时期,ABA,表达模式,高光效育种,候选基因,昼夜节律
AB值：
0.267813
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