热激蛋白90(HSP90,heat shock protein 90)广泛参与生物体的生长发育,对研究信号转导、细胞周期调控、蛋白降解及转运等生理生化代谢具有重要研究价值.为全面解析谷子HSP90基因家族信息,找到重要耐旱SiHSP90的优异单倍型,基于谷子基因组数据,利用生物信息学的方法对谷子HSP90基因家族成员进行了鉴定分析.结果表明,从谷子基因组水平共鉴定到9个SiHSP90基因家族,分布于5条染色体上,内含子数1～19个不等,编码蛋白质氨基酸个数为404～818;系统进化树分析结果显示,谷子HSP90基因家族分为4组;亚细胞定位预测结果显示该基因家族主要位于细胞质和内质网;基于已发表的谷子转录组数据进行组织表达分析,不同HSP90基因家族在不同组织中的表达模式不同;顺式作用元件分析得到9个响应胁迫与激素调控元件,表明谷子HSP90基因家族可在不同非生物胁迫下进行转录调控,响应不同的环境胁迫.耐旱与旱敏感的表达谱分析表明,HSP90基因家族SiHSP90-9在两类材料的多个组织表现极显著差异表达,对532份谷子品种SiHSP90-9基因进行单倍型分析发现,基因区变异极少,启动子区变异丰富,共分为4个单倍型,结合表型分析发现H004是最优异耐旱单倍型,且核心变异位点位于结合茉莉酸甲酯的顺式作用元件核心序列.

谷子;HSP90;基因家族;基因表达;单倍型分析

河南科技大学农学院,洛阳471023;中国农业科学院作物科学研究所,北京100081

[1]桑璐曼;汤沙;张仁梁;贾小平;刁现民-.谷子热激蛋白HSP90基因家族鉴定及分析)[J].植物遗传资源学报,2022(04):1085-1097

SiHSP90,H004

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