典型文献
马铃薯PIF家族成员鉴定及其对高温胁迫的响应分析
文献摘要：
植物光敏色素作用因子(phytochrome interacting factors,PIFs)属于碱性-螺旋-环-螺旋(basic helix-loop-helix,bHLH)转录因子家族,通过将光和温度等外部环境信号与植物体内源信号途径相整合,进而形成复杂的信号转导网络来精密调控植物的生长发育进程.目前,关于马铃薯PIF家族基因的研究较少,鉴定和分析StPIF家族成员有助于进一步提高马铃薯的产量和品质.本研究运用生物信息学方法,以拟南芥PIF家族成员蛋白序列作为源序列,通过在马铃薯基因组数据库中进行BlastP分析鉴定出7个StPIFs家族成员,并对其进行系统进化、染色体分布、复制事件、蛋白理化性质、基因结构、Motif预测、启动子顺式作用元件、基因表达模式以及对高温胁迫的响应分析.结果显示,StPIF家族所有成员均含有Motif 1(bHLH结构域)、Motif 2(APB结构域)基序;在StPIF基因的启动子区域预测到多个参与光响应、激素、干旱、低温、昼夜节律以及防御和应激反应调控元件;基因表达模式和现蕾期高温胁迫响应分析表明,家族成员具有明显的组织表达特异性,基因存在功能分化,且大部分StPIF成员对生物胁迫和高温等非生物胁迫具有明显响应.以上研究结果极大丰富了我们对StPIF家族的认识,为进一步探究StPIF基因在马铃薯生长期应对生物胁迫以及在结薯期应对高温等非生物胁迫中发挥的功能奠定了理论基础.
文献关键词：
马铃薯(Solanum tuberosum L.);PIF家族;生物信息学;高温;表达模式分析
中图分类号：
作者姓名：
荐红举;尚丽娜;金中辉;丁艺;李燕;王季春;胡柏耿;Vadim Khassanov;吕典秋
作者机构：
西南大学农学与生物科技学院, 重庆 400715;南方山地农业教育部工程研究中心, 重庆 400715;薯类生物学与遗传育种重庆市重点实验室, 重庆 400715;国家马铃薯工程技术研究中心, 山东德州 253600;S. Seifullin Kazakh Agrotechnical University, Zhenis Avenue 010011, Astana, Republic of Kazakhstan
文献出处：
引用格式：
[1]荐红举;尚丽娜;金中辉;丁艺;李燕;王季春;胡柏耿;Vadim Khassanov;吕典秋-.马铃薯PIF家族成员鉴定及其对高温胁迫的响应分析)[J].作物学报,2022(01):86-98
A类：
StPIF,BlastP,StPIFs
B类：
成员鉴定,响应分析,光敏色素作用因子,phytochrome,interacting,factors,basic,helix,loop,bHLH,环境信号,植物体,内源信号,信号途径,信号转导,发育进程,家族基因,产量和品质,研究运用,生物信息学方法,拟南芥,列作,马铃薯基因组,基因组数据,分析鉴定,系统进化,基因结构,Motif,顺式作用元件,基因表达模式,结构域,APB,基序,启动子区域,域预测,光响应,昼夜节律,应激反应,反应调控,现蕾期,高温胁迫响应,组织表达,达特,非生物胁迫,极大丰富,生长期,结薯,Solanum,tuberosum,表达模式分析
AB值：
0.328404
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
