典型文献
小麦Lhc基因家族鉴定与表达模式分析
文献摘要:
捕光叶绿素a/b结合蛋白(Lhc,light-harvesting chlorophyll a/b-binding protein)直接影响光合系统的效率和作物产量.小麦作为我国主要粮食作物之一,生长发育过程中,非生物胁迫严重影响小麦的产量和品质.为了系统研究小麦Lhc基因家族的特性,本研究对普通小麦中的Lhc基因家族成员进行了鉴定和生物信息学分析,并选择其中的差异显著或高表达基因进行了定量表达分析.结果显示,从小麦基因组中共鉴定到96个Lhc基因,除4个基因(TaLhca5.1、TaLhcb1.31、TaLhcb1.39和TaLhcb1.29)未定位到具体染色体外,其余基因分布于除3A和3D外的19条染色体上;这些Lhc基因在系统发育上分属于3个亚家族,处于同一分支的基因具有相似的基因结构与motif;在Lhc基因的启动子区域,发现存在大量的胁迫响应元件和生长发育相关响应元件;Lhc基因在根、茎、叶、穗和籽粒等器官中的表达模式不同,其中在叶中的表达较高;在所选的4个基因中,TaLhca3.3、TaLhcb1.7和TaLhcb1.20的表达量呈现先升高后降低的趋势,TaLhcb1.46呈下调表达趋势.
文献关键词:
小麦;Lhc基因家族;表达分析;非生物胁迫
中图分类号:
作者姓名:
赵奇;茹京娜;李宜统;王超;徐兆师;王睿辉
作者机构:
河北农业大学农学院/华北作物改良与调控国家重点实验室,保定071001;中国农业科学院作物科学研究所/国家农作物基因资源与基因改良重大科学工程/农业部麦类生物学与遗传育种重点实验室,北京100081
文献出处:
引用格式:
[1]赵奇;茹京娜;李宜统;王超;徐兆师;王睿辉-.小麦Lhc基因家族鉴定与表达模式分析)[J].植物遗传资源学报,2022(06):1766-1781
A类:
Lhc,TaLhca5,TaLhcb1,TaLhca3
B类:
基因家族鉴定,表达模式分析,叶绿素,结合蛋白,light,harvesting,chlorophyll,binding,protein,光合系统,作物产量,主要粮食作物,非生物胁迫,产量和品质,普通小麦,生物信息学分析,高表达基因,定量表达,表达分析,未定,基因分布,3A,系统发育,分属,亚家族,基因结构,motif,启动子区域,胁迫响应,响应元,籽粒
AB值:
0.257414
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