典型文献
谷子Ⅲ型PRX基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下表达分析
文献摘要:
Ⅲ型过氧化物酶(ClassⅢperoxidase,PRX)是植物中特有的过氧化物酶家族,在植物生长发育以及非生物胁迫中发挥重要作用.谷子作为C4植物是禾本科抗逆研究的模式植物,然而目前对于谷子中Ⅲ型过氧化物酶家族基因功能鲜有报道.为探究谷子Ⅲ型过氧化物酶基因家族(SitPRXs)在干旱胁迫和ABA诱导下的表达模式,进行了全基因组表达分析.本研究利用生物信息学方法在谷子全基因组中鉴定出132个Ⅲ型PRX基因家族成员,并根据其在染色体上位置顺序依次命名为SitPRX1~SitPRX132.通过对谷子、拟南芥和水稻的系统进化分析将其分为5个亚家族,基因结构和保守基序分析表明同一亚家族具有较高的保守性.基因复制分析显示,17个SitPRX基因(13%)存在片段复制,78个SitPRX基因(59%)存在串联复制,串联复制事件在SitPRX基因扩增中起重要作用.谷子与拟南芥、水稻和玉米的物种间同源性分析显示谷子中大多数SitPRXs是在双子叶植物和单子叶植物分化后形成的.转录组分析显示,SitPRX基因家族成员在谷子幼苗、根、茎、叶以及圆锥花序中表达存在差异.启动子顺式作用元件分析显示,79个SitPRXs含有与干旱胁迫响应相关的顺式作用元件,进一步qRT-PCR分析显示,SitPRX12、SitPRX41、SitPRX81、SitPRX110和SitPRX126受PEG和ABA诱导表达,表明这些基因可能通过ABA依赖的信号通路来调控和响应干旱胁迫,可作为进一步研究Ⅲ型PRX基因家族抗旱功能的候选基因.研究结果为全面解析SitPRX基因结构与生物学功能、抗旱分子机制以及分子育种提供了新信息,以期为今后培育高效抗逆作物新品种提供思路.
文献关键词:
Ⅲ型过氧化物酶;基因家族分析;干旱胁迫响应;谷子
中图分类号:
作者姓名:
马鑫磊;许瑞琪;索晓曼;李婧实;顾鹏鹏;姚锐;林小虎;高慧
作者机构:
河北省作物逆境生物学重点实验室, 河北秦皇岛 066004;河北科技师范学院农学与生物科技学院, 河北秦皇岛 066004
文献出处:
引用格式:
[1]马鑫磊;许瑞琪;索晓曼;李婧实;顾鹏鹏;姚锐;林小虎;高慧-.谷子Ⅲ型PRX基因家族全基因组鉴定及干旱胁迫下表达分析)[J].作物学报,2022(10):2517-2532
A类:
SitPRXs,SitPRX1,SitPRX132,SitPRX,SitPRX12,SitPRX41,SitPRX81,SitPRX110,SitPRX126
B类:
谷子,全基因组鉴定,表达分析,Class,peroxidase,植物生长发育,非生物胁迫,C4,禾本科,抗逆,家族基因,基因功能,酶基因,ABA,表达模式,研究利用,利用生物,生物信息学方法,上位,拟南芥,水稻,系统进化分析,亚家族,基因结构,保守基序,保守性,基因复制,基因扩增,种间,同源性分析,双子叶,单子叶植物,转录组分析,幼苗,圆锥花序,启动子,顺式作用元件,干旱胁迫响应,qRT,PEG,诱导表达,候选基因,生物学功能,抗旱分子机制,分子育种,新信息,逆作,新品种,基因家族分析
AB值:
0.231257
相似文献
机标中图分类号,由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成,仅供学习研究参考。