典型文献
陆地棉WRKYⅠ亚家族成员的鉴定与表达分析
文献摘要：
WRKY转录因子参与植物生长发育以及胁迫响应等生命活动的调控.尽管棉花GhWRKY的研究已有报道,但有关GhWRKYⅠ亚家族成员的功能还知之甚少.研究聚焦陆地棉(Gossypium hirsutum)GhWRKYⅠ亚家族成员的全基因组鉴定,以期筛选到参与棉花种子萌发调控的GhWRKY成员;基于陆地棉基因组数据库,应用组学工具对陆地棉GhWRKYⅠ亚家族成员进行鉴定,分析基因结构、蛋白保守基序、保守结构域和蛋白理化性质以及进化关系;基于转录组数据分析GhWRKYⅠ成员在不同组织和5种非生物胁迫下的表达谱;定量PCR(qPCR)检测候选GhWRKY在发育种子的表达特性.结果表明,从陆地棉基因组共鉴定到35个GhWRKYⅠ亚家族基因,不均匀分布于A和D亚基因组的19条染色体上;GhWRKYⅠ蛋白由331～769个氨基酸组成,均为亲水性蛋白并定位于细胞核;GhWRKYⅠ亚家族基因具有3～6个外显子和2～5个内含子.GhWRKY3、GhWRKY6、GhWRKY7、GhWRKY11、GhWRKY12和GhWRKY15未检测到5'-UTR,其余29个GhWRKYⅠ亚家族基因则含有5'-UTR和3'-UTR.仅发现GhWRKY11蛋白C端WRKY保守结构域WRKYGQK序列突变为WRNYGQK,GhWRKYⅠ亚家族成员存在着3种不同的进化方向.转录组数据分析表明,GhWRKYⅠ家族成员在不同组织以及应对不同非生物胁迫呈现差异化表达模式.qPCR分析揭示,GhWRKY24在棉籽萌发72 h内持续上调表达,预示着GhWRKY24可能参与调控棉籽萌发过程.
文献关键词：
陆地棉;WRKY转录因子;基因表达模式;种子萌发
中图分类号：
作者姓名：
韩立军;刘宝玲;李润植;薛金爱
作者机构：
山西农业大学 分子农业与生物能源研究所,山西 太谷 030801
文献出处：
引用格式：
[1]韩立军;刘宝玲;李润植;薛金爱-.陆地棉WRKYⅠ亚家族成员的鉴定与表达分析)[J].山西农业科学,2022(10):1359-1367
A类：
GhWRKY,GhWRKY3,GhWRKY6,GhWRKY7,GhWRKY11,GhWRKY12,GhWRKY15,WRNYGQK,GhWRKY24
B类：
亚家族,表达分析,植物生长发育,胁迫响应,生命活动,棉花,知之甚少,Gossypium,hirsutum,全基因组鉴定,花种,种子萌发,陆地棉基因组,基因组数据,基因结构,保守基序,保守结构域,进化关系,转录组数据,不同组织,非生物胁迫,表达谱,qPCR,测候,育种,表达特性,家族基因,不均匀分布,亚基因组,氨基酸组成,亲水性,细胞核,外显子,内含子,未检,UTR,WRKYGQK,差异化表达,棉籽,预示,基因表达模式
AB值：
0.226349
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