典型文献
玉米NRL基因家族鉴定与逆境表达分析
文献摘要：
NRL(NPH3/RPT2-Like)是植物所特有的一类光响应蛋白,在向光素信号途径中发挥重要作用.利用生物信息学手段结合qRT-PCR技术,在玉米基因组水平对该家族基因进行鉴定并对其编码蛋白的性质、结构、进化、生育期组织表达和逆境表达进行分析.结果鉴定了31个ZmNRL基因,不均匀地分布于玉米9条染色体上,编码的氨基酸序列长度在464～749个,预测具有叶绿体、细胞核和细胞质等亚细胞定位.依据蛋白保守性将ZmNRL家族划分为四大类,基因结构也具有一定的保守性,多数基因含有4个外显子.基因启动子存在大量脱落酸、茉莉酸、光响应和抗氧化等顺式元件分析,其中G-box和Sp1等两类光相关元件数量较多.ZmNRL家族基因在生育期组织部位表达具有一定的时空特异性,总体表达量不高,仅有ZmNRL2、ZmNRL4、ZmNRL24和ZmNRL29相对高表达.通过生育期组织表达数据共表达及其模块GO富集分析发现,6个ZmNRL基因可通过叶绿体等生物发生及组装生物过程,参与对叶片生长发育的调控.qRT-PCR结果表明,高温处理玉米幼苗ZmNRL12上调表达显著,干旱、盐和病原物接种处理ZmNRL5、ZmNRL7和ZmNRL19基因下调表达.综上,在玉米基因组鉴定出31个ZmNRL基因,该家族基因不仅具有明显的组织表达特异性,而且可参与玉米幼苗对生物和非生物逆境应答.
文献关键词：
玉米;NRL;基因家族;逆境胁迫;表达分析
中图分类号：
作者姓名：
赵长江;都梦翔;宋巨奇;徐尚缘;贺琳;徐晶宇;杨克军;李佐同
作者机构：
黑龙江八一农垦大学 农学院,黑龙江 大庆 163319;农业农村部东北平原农业绿色低碳重点实验室,黑龙江 大庆 163319;黑龙江省秸秆资源化利用工程技术研究中心,黑龙江 大庆 163319;黑龙江省现代农业栽培技术与作物种质改良重点实验室,黑龙江 大庆 163319
文献出处：
引用格式：
[1]赵长江;都梦翔;宋巨奇;徐尚缘;贺琳;徐晶宇;杨克军;李佐同-.玉米NRL基因家族鉴定与逆境表达分析)[J].华北农学报,2022(04):1-10
A类：
NPH3,RPT2,ZmNRL,ZmNRL2,ZmNRL4,ZmNRL24,ZmNRL29,ZmNRL12,ZmNRL5,ZmNRL7,ZmNRL19
B类：
基因家族鉴定,表达分析,Like,植物所,光响应,向光,信号途径,利用生物,qRT,家族基因,编码蛋白,生育期组,组织表达,氨基酸序列,叶绿体,细胞核,细胞质,亚细胞定位,保守性,基因结构,外显子,基因启动子,脱落酸,茉莉酸,顺式,box,Sp1,关元,件数,组织部位,时空特异性,共表达,富集分析,生物发生,生物过程,叶片生长,高温处理,玉米幼苗,原物,达特,非生物逆境,逆境应答,逆境胁迫
AB值：
0.289748
相似文献
机标中图分类号，由域田数据科技根据网络公开资料自动分析生成，仅供学习研究参考。
