典型文献
马铃薯PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析
文献摘要:
作为关键信号分子,脱落酸(ABA)通过其核心信号通路PYLs-PP2Cs-SnRK2s广泛调控植物的生长发育和逆境响应过程,PYLs蛋白作为ABA信号传导的核心组件,在ABA信号传导中发挥着不可替代的作用.为探究PYLs(PYR/PYL/RCARs)基因在马铃薯中的进化以及表达模式,本研究从马铃薯全基因组'DM-v 6.1'共鉴定到17个StPYLs基因,并对其分布、蛋白理化性质、系统进化、基因结构特征以及基因表达模式进行了分析.结果表明,17个StPYLs基因不均匀分布在8条染色体上,其氨基酸大小在163~231 aa之间,等电点在4.5~8.6之间,相对分子量在18.71~25.29 kD之间.根据基因结构和蛋白的系统发育特征,StPYL家族成员共分为3个亚组,motif 1存在于本家族所有基因中,说明它在StPYLs的进化过程中较为保守.基因表达模式分析表明,StPYL家族成员具有明显的组织表达特异性,且除StPYL1在外源激素(BAP、ABA和IAA)和非生物胁迫(高温、盐和干旱)下均上调表达外,其余基因存在功能分化,不同胁迫下的表达模式各异.本研究结果为进一步阐明StPYLs基因在马铃薯中的功能奠定了理论基础.
文献关键词:
马铃薯;PYL基因家族;脱落酸;基因表达分析
中图分类号:
作者姓名:
贾小霞;齐恩芳;马胜;黄伟;郑永伟;白永杰;文国宏
作者机构:
甘肃省农业科学院马铃薯研究所 / 甘肃省马铃薯种质资源创新工程实验室, 甘肃兰州 730070;国家种质资源渭源观测实验站, 甘肃渭源 748201
文献出处:
引用格式:
[1]贾小霞;齐恩芳;马胜;黄伟;郑永伟;白永杰;文国宏-.马铃薯PYL基因家族的全基因组鉴定及表达分析)[J].作物学报,2022(10):2533-2545
A类:
StPYLs,StPYL,StPYL1
B类:
马铃薯,基因家族,全基因组鉴定,信号分子,脱落酸,ABA,PP2Cs,SnRK2s,逆境响应,响应过程,信号传导,PYR,RCARs,DM,系统进化,基因结构,基因表达模式,不均匀分布,aa,等电点,相对分子量,kD,系统发育,发育特征,motif,本家,表达模式分析,组织表达,达特,外源激素,BAP,IAA,非生物胁迫,基因表达分析
AB值:
0.306715
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