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典型文献
MMP14和KLKB1可能是脓毒症诊治的潜在生物标志物
文献摘要:
目的:对脓毒症患者进行蛋白质质谱分析,寻找脓毒症诊治的潜在新靶点。方法:采用横断面观察研究方法,纳入2019年1月至12月在西南医科大学附属医院急诊科急诊重症监护病房(EICU)就诊的12例脓毒症患者及同期9例健康体检者。采集两组受试者外周血进行蛋白质质谱分析,并采用非依赖性采集技术得到各蛋白表达数据。将所得数据导入整合差异表达和通路分析在线网络工具IDEP2,对数据进行ID转换,并进行均一化处理,验证其可比性,再用主成分分析剔除离群数据。以 P<0.05、log 2差异倍数(FC)>1或log 2FC<-1为差异有统计学意义,筛选出差异蛋白。用DAVID在线网站将筛选出的差异蛋白进行基因本体(GO)分析,从蛋白质的生物过程、细胞组分、分子功能3个方面对蛋白进行富集分析,同时进行京都基因与基因组百科全书数据库(KEGG)通路分析。通过基因与蛋白质相互作用检索数据库(STRING)在线网站进行蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)分析,找到紧密联系的相关蛋白。 结果:两组数据经均一化处理后提示具有可比性。最终共筛选出125个差异蛋白,其中99个上调,26个下调。GO富集分析显示,筛选出的差异蛋白主要分布在细胞外,具有细胞调节功能及催化活性,参与生物调节、代谢过程及免疫过程;KEGG通路分析提示这些蛋白参与了氨基酸、糖类代谢及免疫相关通路。PPI分析显示,关键蛋白主要为基质金属蛋白酶14(MMP14)、纤维蛋白1(FBLN1)和血浆激肽释放酶1(KLKB1)等,最终筛选出与炎症、免疫等紧密相关的MMP14及KLKB1,二者可能是早期诊治脓毒症的潜在新靶点。结论:MMP14和KLKB1可能为脓毒症诊治及预后判断的潜在生物标志物。
文献关键词:
脓毒症;生物信息学;蛋白质组学;生物标志物
作者姓名:
冯立波;刘玉;陈睦虎;胡迎春
作者机构:
西南医科大学附属医院胃肠外科,四川泸州 646000;西南医科大学附属医院心电图科,四川泸州 646000;西南医科大学附属医院急救医学科,四川泸州 646000;西南医科大学临床医学系,四川泸州 646000
引用格式:
[1]冯立波;刘玉;陈睦虎;胡迎春-.MMP14和KLKB1可能是脓毒症诊治的潜在生物标志物)[J].中华危重病急救医学,2022(07):676-681
A类:
KLKB1,IDEP2,2FC
B类:
MMP14,脓毒症,潜在生物标志物,质谱分析,新靶点,横断面,观察研究,大学附属医院,医院急诊科,急诊重症监护病房,EICU,健康体检者,非依赖性,采集技术,得数,数据导入,差异表达,通路分析,在线网络,网络工具,均一化,可比性,离群数据,log ,倍数,出差,差异蛋白,DAVID,基因本体,生物过程,富集分析,京都基因与基因组百科全书,蛋白质相互作用,STRING,PPI,细胞调节,调节功能,催化活性,代谢过程,白参,糖类,免疫相关,相关通路,关键蛋白,基质金属蛋白酶,纤维蛋白,FBLN1,激肽释放酶,早期诊治,预后判断,蛋白质组学
AB值:
0.26899
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