典型文献
基于GEO数据库的黄芪-当归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的分子机制研究
文献摘要:
目的 探究经典中药配伍组合黄芪-当归药对(芪归药对)对糖尿病合并心血管并发症的治疗作用及分子机制.方法 运用BATMAN数据库对芪归药对进行分析,检索GEO数据库中关于糖尿病合并心血管并发症的相关基因芯片数据,借助GEO2R分析差异基因,构建靶点互作关系网络,拓扑得到芪归药对治疗糖尿病心血管并发症的关键基因;运用DAVID数据库对关键基因进行基因本体功能和KEGG通路富集分析.将20只SD大鼠随机分为健康对照组、糖尿病合并心血管并发症模型组、阳性对照二甲双胍治疗组和芪归药对治疗组,每组5只;除健康对照组外,其余各组均给予高脂高糖饲料并建立糖尿病合并心血管并发症模型;观察各组大鼠心肌细胞中PI3K、Akt3蛋白的表达情况.结果(1)在BATMAN数据库中分析得到芪归药对的相关靶点基因1332个,在GEO数据库中检索得到3个糖尿病合并心血管病变的芯片数据文件(GSE26887、GSE43950、GSE46262),利用GEO2R分析筛选出2759个差异基因;经映射得到芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的关键基因247个.(2)通过STRING数据库构建关键靶点的差异蛋白相互作用(PPI)网络图,运用Cytoscape 3.7.2构建"芪归药对—活性成分—靶点"网络.采用DAVID数据库进行功能富集分析提示,芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的生物学进程主要集中在RNA聚合酶Ⅱ启动子转录的正负调控、氧化还原过程、信号转导、凋亡过程、炎症反应、细胞增殖的正调控等,信号通路涉及新陈代谢通路、癌症通路、肿瘤坏死因子(TNF)信号通路、5'-单磷酸(cAMP)信号通路、环磷酸鸟苷酸-蛋白激酶(cGMP-PKG)信号通路、磷脂酰肌醇3-激酶与丝氨酸/苏氨酸激酶(PI3K-Akt)信号通路、非酒精性脂肪肝通路、胰岛素抵抗通路等.(3)采用SD大鼠的动物模型实验结果显示,与健康对照组比较,未接受治疗的糖尿病合并心血管并发症模型组心肌细胞中PI3K、Akt3蛋白表达量均明显降低(P<0.01);芪归药对治疗组和二甲双胍治疗组心肌细胞中PI3K表达量均高于模型组(P<0.01),但低于健康对照组(P<0.01);芪归药对治疗组Akt3蛋白表达量低于健康对照组(P<0.05),二甲双胍治疗组Akt3蛋白表达量高于模型组(P<0.05).结论 芪归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的特点是"多成分、多靶点、多途径",多个关键基因和信号通路发挥了重要作用,进一步研究有望拓宽糖尿病中医药诊疗的思路.
文献关键词:
糖尿病合并心血管并发症;黄芪-当归;GEO数据库;生物信息学
中图分类号:
作者姓名:
董又滋;赵泉霖;王毓国
作者机构:
山东中医药大学第一临床医学院,山东济南 250014;山东中医药大学附属医院综合内科,山东济南 250014;解放军总医院第六医学中心中医学部,北京 100142
文献出处:
引用格式:
[1]董又滋;赵泉霖;王毓国-.基于GEO数据库的黄芪-当归药对治疗糖尿病合并心血管并发症的分子机制研究)[J].解放军医学杂志,2022(12):1190-1200
A类:
糖尿病合并心血管并发症,GSE26887,GSE43950,GSE46262
B类:
黄芪,当归,中药配伍,配伍组合,芪归药对,治疗作用,BATMAN,基因芯片,GEO2R,差异基因,互作关系,关系网络,关键基因,DAVID,基因本体,通路富集分析,阳性对照,二甲双胍治疗,高脂高糖,大鼠心肌细胞,PI3K,Akt3,靶点基因,心血管病变,数据文件,STRING,数据库构建,关键靶点,差异蛋白,蛋白相互作用,PPI,网络图,Cytoscape,活性成分,功能富集分析,启动子,正负,负调控,氧化还原,还原过程,信号转导,正调控,新陈代谢通路,癌症通路,单磷酸,cAMP,环磷酸鸟苷,鸟苷酸,蛋白激酶,cGMP,PKG,磷脂酰肌醇,丝氨酸,苏氨酸,非酒精性脂肪肝,胰岛素抵抗,动物模型,模型实验,未接,多成分,多靶点,多途径
AB值:
0.197631
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