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典型文献
基于网络药理学和分子对接探究甘草附子汤治疗类风湿关节炎的机制
文献摘要:
目的 通过网络药理学结合分子对接的研究方法预测甘草附子汤治疗类风湿关节炎(RA)的作用靶点,探究其治疗RA的作用机制.方法 通过中药系统药理学数据库与分析平台(TCMSP)检索甘草附子汤中包含的4种中药的有效成分及其靶基因.从基因表达汇编(GEO)数据库中下载RA数据,筛选RA患者与健康人群关节滑膜组织的差异基因并与甘草附子汤有效成分靶基因取交集,获得甘草附子汤治疗RA的潜在靶基因.通过Cytoscape 3.7.1软件构建中药-活性成分-疾病靶点网络,并分析网络节点度值以筛选关键活性成分.通过蛋白质-蛋白质相互作用(PPI)网络分析得到甘草附子汤治疗RA的关键蛋白靶点,利用Metascape数据库对甘草附子汤治疗RA的潜在靶基因进行基因本体(GO)分析及京都基因和基因组百科全书(KEGG)通路富集分析预测其作用机制.应用AutoDockTools-1.5.6及PyMOL软件进行分子对接,验证甘草附子汤的活性成分与其治疗RA关键靶点的结合能力.结果 获得甘草附子汤治疗RA的潜在靶基因44个.构建的中药-活性成分-疾病靶点网络包含药材节点4个、活性成分节点95个、潜在靶基因节点44个.网络拓扑结构分析显示槲皮素度值最高,可能为甘草附子汤治疗RA的关键活性成分.甘草附子汤治疗RA的机制涉及对无机物的反应等生物过程、膜筏等细胞组分、CXCR趋化因子受体结合等分子功能.KEGG分析显示甘草附子汤活性成分主要通过IL-17信号通路、TNF信号通路、破骨细胞分化等途径作用于RA.PPI网络分析结果显示基质金属蛋白酶9(MMP9)、C-X-C基序趋化配体8(CXCL8)、过氧化物酶体增殖物激活受体γ(PPARγ)、表皮生长因子受体(EGFR)为甘草附子汤治疗RA的关键靶点.分子对接证实槲皮素与关键靶点分子MMP9、CXCL8、PPARγ、EGFR具有较高的亲和力.结论 甘草附子汤中的活性成分可能通过MMP9、CXCL8、PPARγ、EGFR等靶点调节多条信号通路,发挥对RA的治疗作用.
文献关键词:
类风湿关节炎;甘草附子汤;网络药理学;作用机制
作者姓名:
叶倩仪;牟兴;卢红娟;蔡斌;张璐定;吴歆
作者机构:
海军军医大学(第二军医大学)第二附属医院风湿免疫科,上海 200003;海军军医大学(第二军医大学)第二附属医院健康管理科,上海 200003
引用格式:
[1]叶倩仪;牟兴;卢红娟;蔡斌;张璐定;吴歆-.基于网络药理学和分子对接探究甘草附子汤治疗类风湿关节炎的机制)[J].海军军医大学学报,2022(11):1288-1297
A类:
B类:
网络药理学,分子对接,甘草附子汤,类风湿关节炎,RA,作用靶点,系统药理学,分析平台,TCMSP,有效成分,靶基因,基因表达汇编,GEO,下载,健康人群,关节滑膜,滑膜组织,差异基因,交集,Cytoscape,软件构建,靶点网络,网络节点,节点度,选关,关键活性成分,蛋白质相互作用,PPI,关键蛋白,蛋白靶点,Metascape,基因本体,京都基因和基因组百科全书,通路富集分析,分析预测,AutoDockTools,PyMOL,关键靶点,结合能,含药,分节,网络拓扑结构,槲皮素,无机物,生物过程,CXCR,趋化因子受体,破骨细胞分化,基质金属蛋白酶,MMP9,基序,CXCL8,过氧化物酶体增殖物激活受体,PPAR,表皮生长因子受体,EGFR,亲和力,多条,治疗作用
AB值:
0.217316
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